46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1356 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  100 
 
 		 111 aa  221  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  99.07 
 
 		 108 aa  213  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  83.96 
 
 		 121 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  63.39 
 
 		 111 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  70 
 
 		 110 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  60.53 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  60.38 
 
 		 112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  67.86 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  67.05 
 
 		 112 aa  123  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  59.18 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  56.19 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  54.46 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  62.03 
 
 		 94 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  48.15 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  51.4 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  48.6 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  58.44 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  53.16 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  52.38 
 
 		 108 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  50 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  47.42 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  42.05 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  43.18 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  53.49 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  29.46 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  31.03 
 
 		 100 aa  48.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  31.03 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  29.89 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  33.71 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  27.38 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  28.44 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  32.1 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  30.84 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  32.18 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  35 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  37.35 
 
 		 289 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  30.09 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  34.62 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  30.49 
 
 		 103 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  29.13 
 
 		 101 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  32.53 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  32.94 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  33.73 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  27.38 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  27.38 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 115 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>