154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4394 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 550 aa  1113    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  58.09 
 
 		 560 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  31.62 
 
 		 556 aa  233  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  32.84 
 
 		 556 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  32.84 
 
 		 556 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  32.84 
 
 		 556 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  34 
 
 		 554 aa  229  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  30.64 
 
 		 551 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  33.6 
 
 		 572 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  33.74 
 
 		 562 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  34.22 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  33.95 
 
 		 560 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  32.13 
 
 		 548 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 		 541 aa  210  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 		 541 aa  210  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 		 541 aa  210  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 		 541 aa  210  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  34.56 
 
 		 599 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  34.56 
 
 		 599 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  28.24 
 
 		 626 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  29.12 
 
 		 630 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  31.96 
 
 		 552 aa  207  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  32.76 
 
 		 547 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  28.91 
 
 		 625 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  31.4 
 
 		 536 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  30.11 
 
 		 636 aa  191  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  34.32 
 
 		 422 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  31.17 
 
 		 542 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  27.34 
 
 		 595 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  33.92 
 
 		 382 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  27.51 
 
 		 611 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  27.11 
 
 		 616 aa  180  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  28.63 
 
 		 640 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  25.73 
 
 		 618 aa  179  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  25.19 
 
 		 618 aa  178  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  25.19 
 
 		 618 aa  178  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  29.59 
 
 		 640 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  29.59 
 
 		 640 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  28.91 
 
 		 640 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  35.56 
 
 		 497 aa  173  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  28.84 
 
 		 632 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  30 
 
 		 614 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  27.75 
 
 		 677 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  27.75 
 
 		 652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  27.75 
 
 		 652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  27.75 
 
 		 652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  27.94 
 
 		 560 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  31.3 
 
 		 322 aa  120  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  26.59 
 
 		 617 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  26.8 
 
 		 810 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 617 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  27.4 
 
 		 567 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  28.84 
 
 		 663 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  27.36 
 
 		 561 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  27.03 
 
 		 555 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  27.49 
 
 		 649 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  27.21 
 
 		 558 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  25.88 
 
 		 581 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  27.25 
 
 		 558 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  24.8 
 
 		 636 aa  101  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 		 614 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 		 614 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 		 614 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  27.71 
 
 		 677 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  29.82 
 
 		 733 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  27.23 
 
 		 721 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  24.54 
 
 		 650 aa  93.6  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  24.4 
 
 		 900 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  24.4 
 
 		 900 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  23.64 
 
 		 902 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  29.25 
 
 		 497 aa  88.2  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  29.25 
 
 		 497 aa  88.2  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  29.25 
 
 		 497 aa  88.2  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  24.51 
 
 		 782 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  23.65 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  23.65 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  27.73 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0212  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 1010 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2895  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 976 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  24.75 
 
 		 886 aa  80.1  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 785 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0246  Integrase catalytic region  24.91 
 
 		 717 aa  79.7  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.337678 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  26.56 
 
 		 902 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  22.89 
 
 		 481 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  25.92 
 
 		 905 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  25.92 
 
 		 905 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  25.92 
 
 		 905 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  25.92 
 
 		 905 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  25.92 
 
 		 905 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3873  Integrase catalytic region  35.37 
 
 		 960 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  24.92 
 
 		 575 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  22.22 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  24.92 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  24.92 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  26.8 
 
 		 696 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  23.17 
 
 		 653 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  23.01 
 
 		 774 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  24.57 
 
 		 696 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>