94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0356 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  68.5 
 
 
257 aa  350  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  53.36 
 
 
255 aa  232  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  48.97 
 
 
243 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  51.64 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  48.36 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  45.6 
 
 
246 aa  202  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  49.8 
 
 
300 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  46.91 
 
 
293 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  46.35 
 
 
253 aa  195  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  47.95 
 
 
255 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  46.53 
 
 
325 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  40.98 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  43.55 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  45.31 
 
 
239 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  45.31 
 
 
324 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  43.55 
 
 
300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  43.37 
 
 
399 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  43.55 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  43.15 
 
 
300 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  43.15 
 
 
300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  43.15 
 
 
300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  42.57 
 
 
399 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  42.17 
 
 
369 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  42.57 
 
 
336 aa  178  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  40.32 
 
 
392 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  44.05 
 
 
301 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  44.44 
 
 
288 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  39.75 
 
 
338 aa  175  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  42.34 
 
 
299 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  43.15 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  49.8 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  47.41 
 
 
303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  41.22 
 
 
295 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  44.69 
 
 
312 aa  168  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  43.03 
 
 
304 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  42.46 
 
 
311 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  38.25 
 
 
355 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  42.06 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  42.06 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  42.06 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  51.24 
 
 
305 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  37.55 
 
 
335 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  37.6 
 
 
364 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  44.62 
 
 
317 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  42.91 
 
 
324 aa  158  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  39.68 
 
 
299 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  43.48 
 
 
293 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  35.95 
 
 
498 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  37.25 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  43.92 
 
 
307 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  40.16 
 
 
295 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  42.4 
 
 
320 aa  148  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  41.73 
 
 
319 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  42.08 
 
 
333 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  42.26 
 
 
298 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  41.7 
 
 
312 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  39.29 
 
 
319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  43.7 
 
 
319 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  41.67 
 
 
298 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  42.23 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  42.37 
 
 
321 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  22.79 
 
 
263 aa  49.3  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  28.87 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  26.54 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0060  hypothetical protein  30.85 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  25.67 
 
 
266 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  25.67 
 
 
266 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  28.4 
 
 
254 aa  45.4  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  27.19 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  25.99 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  23.48 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  25.67 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  28.07 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.83 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  28.29 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  26.57 
 
 
274 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  27.19 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  25.59 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  27.19 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  27.19 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  27.19 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  25.59 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  27.19 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  29.37 
 
 
264 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  24.2 
 
 
274 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  29.37 
 
 
268 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  28.83 
 
 
266 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  28.83 
 
 
266 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1631  protein of unknown function DUF81  22.54 
 
 
237 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000001538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  25.69 
 
 
269 aa  42  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  31.17 
 
 
272 aa  42  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  27.12 
 
 
220 aa  42  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  25.35 
 
 
264 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>