212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2720 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
353 aa  718    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  58.24 
 
 
328 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  43.11 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  40.9 
 
 
372 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  40.18 
 
 
349 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.96 
 
 
340 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 
342 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  36.39 
 
 
345 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  37.24 
 
 
366 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  35.95 
 
 
355 aa  199  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  35.42 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  34.74 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  35.71 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  37.35 
 
 
356 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  33.81 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  33.71 
 
 
335 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  31.91 
 
 
337 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 
337 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  34.46 
 
 
338 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 
337 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 
339 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  34.43 
 
 
336 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  32.58 
 
 
339 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  32.29 
 
 
339 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  35.84 
 
 
348 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  32.77 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
338 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 
341 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  32.53 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 
341 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  31.75 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  31.85 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 
337 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  33.24 
 
 
354 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 
333 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  31.92 
 
 
338 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  33.73 
 
 
347 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  32.63 
 
 
344 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  32.45 
 
 
423 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 
351 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  33.73 
 
 
344 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 
358 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  32.24 
 
 
343 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  31.16 
 
 
343 aa  155  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 
342 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 
342 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 
342 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  30.31 
 
 
329 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  31.62 
 
 
340 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1462  extracellular solute-binding protein family 1  30.06 
 
 
392 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  30.79 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  29.94 
 
 
340 aa  133  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 
345 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 
337 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
355 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  32.34 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  29.04 
 
 
350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  29.9 
 
 
342 aa  113  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 
337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 
353 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 
351 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  26.09 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  28.57 
 
 
341 aa  110  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
374 aa  109  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 
348 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
347 aa  109  8.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 
335 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  28.66 
 
 
346 aa  108  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 
352 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 
372 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
348 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 
347 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  27.38 
 
 
349 aa  105  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
339 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 
352 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  29 
 
 
351 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.57 
 
 
334 aa  104  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  25.58 
 
 
335 aa  104  3e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
341 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
382 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
372 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 
381 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  27.54 
 
 
334 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 
337 aa  103  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 
349 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 
360 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  28.53 
 
 
347 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 
345 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 
337 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  30.9 
 
 
347 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  25.63 
 
 
337 aa  100  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
339 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  26.65 
 
 
334 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>