More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1601 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  100 
 
 
270 aa  545  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  32.67 
 
 
250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 
243 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  32.37 
 
 
243 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  33.06 
 
 
243 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  33.88 
 
 
243 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  32.37 
 
 
243 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  31.12 
 
 
243 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  31.84 
 
 
244 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  34.15 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  28.79 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  32.26 
 
 
241 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  27.71 
 
 
261 aa  85.9  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.71 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  28.17 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  34.95 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  30.59 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  29.41 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  38.58 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  27.48 
 
 
630 aa  73.2  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  33.03 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  25.9 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  24.9 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  30.45 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  31.15 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.49 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  27.45 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.86 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.1 
 
 
545 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.75 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  23.97 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  30.74 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  29.22 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.92 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  30.74 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  25.4 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  30.86 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  30.86 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  30.86 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  27.2 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  30.86 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  31.28 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  25 
 
 
564 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  30.86 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  30.86 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  30.86 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.08 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  26.07 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.54 
 
 
225 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  30.83 
 
 
219 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  28.37 
 
 
391 aa  62.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.1 
 
 
556 aa  62.4  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  27.03 
 
 
253 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.81 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  33.69 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  28.57 
 
 
399 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  29.92 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  27.63 
 
 
622 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  25.39 
 
 
253 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  31.58 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.99 
 
 
241 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  28.93 
 
 
219 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  28.79 
 
 
249 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.6 
 
 
374 aa  59.7  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  32.81 
 
 
392 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
622 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  30.64 
 
 
228 aa  59.3  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  36.67 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  30.28 
 
 
393 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.58 
 
 
428 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  35.46 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2615  putative sugar nucleotidyltransferase  34.35 
 
 
208 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.7 
 
 
561 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.7 
 
 
561 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1776  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.07 
 
 
451 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  24.3 
 
 
561 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  30.71 
 
 
388 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  35.46 
 
 
251 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  23.9 
 
 
561 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  23.9 
 
 
561 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  36.17 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  32.76 
 
 
232 aa  56.6  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.69 
 
 
562 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  29.53 
 
 
393 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  27.48 
 
 
396 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  37.61 
 
 
227 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0288  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  34.55 
 
 
452 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.3 
 
 
562 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.51 
 
 
562 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
400 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  27.38 
 
 
241 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  31.43 
 
 
393 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  24.7 
 
 
400 aa  55.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  27.59 
 
 
228 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  24.1 
 
 
578 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 
411 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  31.4 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  34.85 
 
 
402 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  32.12 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  30 
 
 
349 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>