More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0985 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
683 aa  1359    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  57.26 
 
 
715 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  37.36 
 
 
699 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4675  ATPase central domain-containing protein  36.13 
 
 
720 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760219  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  38.52 
 
 
625 aa  247  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0020  AAA ATPase, central region  31.03 
 
 
697 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1361  AAA ATPase, central region  31.56 
 
 
704 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252526  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0808  ATPase central domain-containing protein  38.68 
 
 
715 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1202  ATPase central domain-containing protein  34.67 
 
 
627 aa  220  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0870142  normal  0.869838 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  39.1 
 
 
715 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1816  ATPase central domain-containing protein  31.48 
 
 
590 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.02 
 
 
679 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.26 
 
 
639 aa  185  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  35.29 
 
 
753 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.84 
 
 
753 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  34.31 
 
 
656 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  33.82 
 
 
645 aa  181  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  35.29 
 
 
681 aa  180  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  34.31 
 
 
682 aa  179  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  34.47 
 
 
654 aa  179  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.05 
 
 
672 aa  178  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.99 
 
 
615 aa  177  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.77 
 
 
662 aa  176  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.51 
 
 
672 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.8 
 
 
635 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.75 
 
 
644 aa  176  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.78 
 
 
660 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2062  vesicle-fusing ATPase  35.96 
 
 
617 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139839  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.25 
 
 
621 aa  173  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.1 
 
 
669 aa  173  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.59 
 
 
666 aa  173  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.47 
 
 
632 aa  173  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  34.3 
 
 
637 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.46 
 
 
696 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3656  AAA ATPase, central region  31 
 
 
694 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.46 
 
 
714 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.41 
 
 
611 aa  172  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.64 
 
 
685 aa  171  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.25 
 
 
602 aa  171  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.87 
 
 
671 aa  171  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.39 
 
 
662 aa  170  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  35.8 
 
 
641 aa  170  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.32 
 
 
793 aa  170  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.08 
 
 
666 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.08 
 
 
666 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  32.02 
 
 
917 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.58 
 
 
659 aa  167  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.66 
 
 
673 aa  168  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.11 
 
 
635 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.09 
 
 
657 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0210  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.93 
 
 
626 aa  167  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  33.56 
 
 
760 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  32.59 
 
 
630 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.6 
 
 
608 aa  167  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.92 
 
 
635 aa  167  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.96 
 
 
643 aa  167  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.49 
 
 
798 aa  167  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.51 
 
 
677 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.23 
 
 
659 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.87 
 
 
666 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.87 
 
 
666 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.87 
 
 
662 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0194  AAA ATPase central domain protein  31.2 
 
 
619 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223838  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.87 
 
 
666 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.74 
 
 
759 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3548  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.77 
 
 
682 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555196  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.81 
 
 
852 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 
794 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.24 
 
 
653 aa  166  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.64 
 
 
781 aa  165  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.95 
 
 
743 aa  165  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.27 
 
 
623 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  32.25 
 
 
514 aa  164  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  33.86 
 
 
659 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.66 
 
 
647 aa  164  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  32.08 
 
 
616 aa  164  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.03 
 
 
750 aa  164  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.87 
 
 
607 aa  164  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  31.01 
 
 
646 aa  164  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.65 
 
 
638 aa  164  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.66 
 
 
620 aa  163  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.78 
 
 
607 aa  163  8.000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.68 
 
 
684 aa  163  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.65 
 
 
638 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.65 
 
 
638 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.41 
 
 
620 aa  163  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.26 
 
 
653 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.95 
 
 
801 aa  162  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.57 
 
 
687 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  31.69 
 
 
614 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.32 
 
 
696 aa  162  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.18 
 
 
618 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.37 
 
 
631 aa  162  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3719  hypothetical protein  36.6 
 
 
449 aa  162  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.43 
 
 
638 aa  162  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.72 
 
 
630 aa  161  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0429  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.58 
 
 
626 aa  161  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0157524  hitchhiker  0.00156876 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  31.29 
 
 
784 aa  161  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.29 
 
 
760 aa  161  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  32.42 
 
 
689 aa  161  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>