More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0886 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 161 aa  329  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  99.38 
 
 		 195 aa  324  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  91.25 
 
 		 161 aa  296  7e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0676  MarR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 172 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  56.76 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  55.24 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  52.67 
 
 		 152 aa  150  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  53.1 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  53.47 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  51.85 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  51.85 
 
 		 150 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.11 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.11 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  51.11 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  52.52 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  48.97 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 154 aa  141  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  53.73 
 
 		 146 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  48.97 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  51.45 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  57.27 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  51.45 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  51.43 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  52.17 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  52.99 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  52.99 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 146 aa  137  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 168 aa  137  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  48.95 
 
 		 153 aa  137  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  52.21 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  51.43 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  44.52 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  52.99 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.58 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  46.76 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.08 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  46.76 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 170 aa  131  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  52.1 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  56.91 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  57.27 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  45.32 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  49.29 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  43.45 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  60.19 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 152 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  50.79 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  46.32 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  44.52 
 
 		 150 aa  124  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 151 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  65.74 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 147 aa  124  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>