More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1463 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
317 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  73.73 
 
 
317 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  60.38 
 
 
325 aa  423  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  63.14 
 
 
315 aa  412  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  61.51 
 
 
316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  59.31 
 
 
313 aa  388  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  58.58 
 
 
317 aa  375  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  60 
 
 
313 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 
311 aa  353  2e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
309 aa  349  3e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 
319 aa  348  8e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
317 aa  328  7e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
326 aa  328  7e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
331 aa  322  4e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
328 aa  311  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
345 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
338 aa  251  2e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
361 aa  246  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
345 aa  240  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
352 aa  224  1e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
348 aa  215  8e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
404 aa  206  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
315 aa  203  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
372 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
372 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  35.38 
 
 
824 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
314 aa  196  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
319 aa  193  3e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
372 aa  192  6e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
336 aa  189  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 
374 aa  189  5e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  37.03 
 
 
349 aa  185  7e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
372 aa  182  7e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 
388 aa  168  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  32.21 
 
 
397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  26.82 
 
 
791 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 
405 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
407 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
400 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  28 
 
 
403 aa  99  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 
404 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 
403 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 
403 aa  96.3  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 
398 aa  95.9  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
414 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
399 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  30.86 
 
 
438 aa  92.8  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 
406 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 
407 aa  92.4  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 
400 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 
413 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0006  tyrosyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 
413 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274156  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  27.47 
 
 
401 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  29.76 
 
 
392 aa  90.5  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 
396 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 
399 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 
403 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 
399 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 
403 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 
399 aa  89.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 
403 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 
396 aa  89.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 
398 aa  89.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 
400 aa  89  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 
403 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 
399 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 
401 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02330  tyrosyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 
403 aa  87.8  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.083172  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
399 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 
399 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 
404 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
399 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 
403 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  29 
 
 
395 aa  86.7  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 
408 aa  86.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
399 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 
399 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
399 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
396 aa  85.9  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_541  tyrosyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.32758  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0601  tyrosyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00761156  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0845  tyrosyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
399 aa  84  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 
402 aa  84  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
399 aa  84  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 
405 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 
401 aa  84  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 
406 aa  82.8  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
398 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>