More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2230 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  49.38 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  48.79 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  29.71 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  29.05 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  37.21 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  32.2 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.13 
 
 		 877 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.45 
 
 		 873 aa  69.3  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  34.43 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.96 
 
 		 769 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  35.04 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  35.04 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  35.04 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 		 873 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  28.03 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  34.96 
 
 		 907 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  38.4 
 
 		 141 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  30.77 
 
 		 880 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 859 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.7 
 
 		 845 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  35.29 
 
 		 909 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  33.06 
 
 		 867 aa  63.2  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.97 
 
 		 903 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  36.11 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  27.62 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  24.61 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  29.73 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  33.88 
 
 		 865 aa  62.4  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  33.1 
 
 		 427 aa  62.4  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  29.23 
 
 		 130 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  36 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  24.06 
 
 		 155 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  30.56 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  33.06 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  30.51 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  29.73 
 
 		 875 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  32.54 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  31.86 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  30.7 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  36.36 
 
 		 904 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  31.86 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.25 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  33.9 
 
 		 907 aa  59.7  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.65 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  23.68 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  31.93 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  34.4 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.03 
 
 		 580 aa  59.3  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 		 385 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  31.36 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  30.97 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  30.89 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.4 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  30 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  30.33 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  27.1 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  31.15 
 
 		 877 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  35.11 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4373  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  29.45 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  28.78 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  26.49 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.46 
 
 		 862 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  31.5 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.05 
 
 		 903 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  31.58 
 
 		 879 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  29.29 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  32.17 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  31.58 
 
 		 879 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  35.59 
 
 		 136 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  34.19 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 		 143 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.05 
 
 		 903 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  31.2 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  31.88 
 
 		 160 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  23.91 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  31.2 
 
 		 615 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  32.58 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>