More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1216 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  42.09 
 
 		 863 aa  699    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  44.42 
 
 		 858 aa  702    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  46.14 
 
 		 871 aa  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  44.21 
 
 		 880 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  44.41 
 
 		 858 aa  710    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  40.23 
 
 		 868 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  45.61 
 
 		 865 aa  685    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  44 
 
 		 858 aa  689    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  40.38 
 
 		 860 aa  645    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 		 903 aa  647    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  42.24 
 
 		 891 aa  669    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 		 867 aa  720    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  48.67 
 
 		 900 aa  835    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 863 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 903 aa  1837    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  44.07 
 
 		 870 aa  696    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 		 868 aa  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  45.99 
 
 		 898 aa  657    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  59.63 
 
 		 872 aa  991    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  44 
 
 		 872 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  43.41 
 
 		 828 aa  678    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  45.32 
 
 		 863 aa  682    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  41.12 
 
 		 853 aa  675    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  44.78 
 
 		 869 aa  736    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 		 881 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  52.79 
 
 		 892 aa  892    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  40.49 
 
 		 872 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  55.73 
 
 		 874 aa  931    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  43.51 
 
 		 870 aa  719    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  50.39 
 
 		 887 aa  883    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 		 859 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  43.63 
 
 		 872 aa  680    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  45.5 
 
 		 932 aa  719    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.12 
 
 		 869 aa  655    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.4 
 
 		 882 aa  643    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.67 
 
 		 872 aa  667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 		 896 aa  719    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 910 aa  675    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 		 910 aa  673    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  45.41 
 
 		 882 aa  656    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  42.42 
 
 		 859 aa  687    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  55.24 
 
 		 864 aa  897    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  45.86 
 
 		 862 aa  713    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  45.23 
 
 		 873 aa  741    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 		 897 aa  700    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  44.85 
 
 		 857 aa  713    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 		 889 aa  688    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 		 850 aa  643    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  43.5 
 
 		 870 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  43.28 
 
 		 854 aa  633  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.06 
 
 		 873 aa  634  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  40.49 
 
 		 904 aa  633  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 		 868 aa  634  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 868 aa  634  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 		 851 aa  629  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  40.14 
 
 		 864 aa  631  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  39.16 
 
 		 894 aa  632  1e-179  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  39.3 
 
 		 863 aa  629  1e-179  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  38.82 
 
 		 895 aa  627  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 887 aa  628  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  38.97 
 
 		 886 aa  628  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 		 878 aa  627  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 859 aa  624  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  45.15 
 
 		 823 aa  625  1e-177  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  39.89 
 
 		 860 aa  624  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 		 875 aa  623  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 892 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 892 aa  622  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.75 
 
 		 871 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 		 855 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 890 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 		 894 aa  620  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 		 859 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 		 871 aa  622  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 		 854 aa  620  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  42.56 
 
 		 872 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 		 855 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  41.69 
 
 		 890 aa  619  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 859 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 		 890 aa  622  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 		 854 aa  616  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  39.42 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 892 aa  619  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 892 aa  619  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 892 aa  619  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  44.13 
 
 		 867 aa  618  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 		 930 aa  616  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 892 aa  619  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  41.78 
 
 		 878 aa  618  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 		 858 aa  616  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 		 881 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  40.04 
 
 		 860 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  41.33 
 
 		 884 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  41.33 
 
 		 884 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 		 861 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 		 896 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  40.6 
 
 		 853 aa  609  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 905 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  41.4 
 
 		 855 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  41.3 
 
 		 888 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>