More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0608 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0608  ribonuclease III  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.815667  normal  0.533927 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1493  ribonuclease III  41.38 
 
 		 154 aa  105  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000322958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  38.85 
 
 		 234 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  32.43 
 
 		 229 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  39.46 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  30.61 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3854  ribonuclease III  35.93 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  33.9 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  35.75 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  35.75 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  35.2 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  37.21 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2224  ribonuclease III  38.67 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0167185 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  34.97 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  32.97 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  31.69 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  39.68 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  36.69 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  35.88 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  34.64 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  34.97 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  35.66 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  32.24 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  34.62 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  34.08 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  35.06 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  34.08 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  33.33 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  31.87 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  34.5 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  33.74 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  35.58 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  36.84 
 
 		 240 aa  72  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  33.33 
 
 		 232 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1315  hypothetical protein  36.57 
 
 		 145 aa  72  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  34.97 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  33.9 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  35.58 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  36.54 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1243  ribonuclease III  34.97 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000271922  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  35.58 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  34.97 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  34.97 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  36.64 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  32.43 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  36.36 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  30 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  34.97 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0304  ribonuclease III  33.33 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.821127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  41.23 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  33.77 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  32.75 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  35.62 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  33.33 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  33.56 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  38.13 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  34.57 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  33.75 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  34.62 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  31.4 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  34.35 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0281  ribonuclease III  33.83 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  28.81 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  34.97 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  34.72 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  34.97 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  34.97 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  30.97 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  32.06 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  32.06 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  32.84 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  31.17 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  28.57 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  33.33 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  33.15 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  31.17 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0037  ribonuclease III  37.86 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1116  ribonuclease III  38.46 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  31.79 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  31.65 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  29.03 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  33.97 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  33.74 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  35.43 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0659  ribonuclease III  31.06 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0117044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  33.33 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1674  Ribonuclease III  26.35 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3054  ribonuclease III  33.97 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255199  hitchhiker  0.00979275 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1101  Ribonuclease III  33.33 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0115033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2722  ribonuclease III  33.33 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.444526  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  34.42 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2853  ribonuclease III  33.33 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0190873  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0374  ribonuclease III  30.41 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.7646  hitchhiker  0.000724257 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  31.25 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2720  ribonuclease III  33.33 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0115218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2932  ribonuclease III  33.33 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.223981  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  31.67 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1110  ribonuclease III  33.33 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3803  ribonuclease III  33.33 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02425  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>