More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1116 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1116  ribonuclease III  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0037  ribonuclease III  61.27 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1315  hypothetical protein  56.06 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2224  ribonuclease III  50.99 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0167185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0304  ribonuclease III  36.49 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.821127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  38.31 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1493  ribonuclease III  38.03 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000322958  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0608  ribonuclease III  38.76 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.815667  normal  0.533927 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  33.79 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  37.59 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  32.33 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  33.1 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  35 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  35 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  36.43 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1014  ribonuclease III  32.87 
 
 		 425 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2899  ribonuclease III  34.09 
 
 		 418 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.560315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1010  ribonuclease III  32.87 
 
 		 425 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0841  ribonuclease III  34.09 
 
 		 441 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2170  ribonuclease III  33.81 
 
 		 406 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290031  normal  0.408262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  37.78 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1092  ribonuclease III  33.81 
 
 		 409 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0654  ribonuclease III  33.81 
 
 		 409 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.988138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1134  ribonuclease III  33.81 
 
 		 409 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  30.83 
 
 		 229 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1085  ribonuclease III  33.33 
 
 		 428 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  31.82 
 
 		 232 aa  70.5  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2815  ribonuclease III  33.81 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0543  ribonuclease III  33.81 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2895  ribonuclease III  33.81 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2466  ribonuclease III  33.81 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3854  ribonuclease III  31.33 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2779  ribonuclease III  33.81 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2840  ribonuclease III  33.81 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1789  ribonuclease III  33.81 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  32.12 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  34.69 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  34.78 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  31.65 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4246  ribonuclease III  33.09 
 
 		 408 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  32.39 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  34.75 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  34.07 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  33.33 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  34.07 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  32.86 
 
 		 228 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  32.37 
 
 		 239 aa  67.4  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1730  ribonuclease III  33.09 
 
 		 469 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  31.58 
 
 		 229 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  31.34 
 
 		 231 aa  67  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  35.71 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  33.09 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  36.8 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  30 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  35.17 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  31.75 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  29.55 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  32.85 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  32.85 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  30.99 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  32.85 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1714  Ribonuclease III  33.81 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.61541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  33.33 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  31.16 
 
 		 256 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  30.37 
 
 		 233 aa  63.5  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  30.43 
 
 		 256 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1565  ribonuclease III  29.45 
 
 		 236 aa  63.5  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  31.16 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  36.43 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  33.1 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  35.04 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  32.85 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  31.16 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  31.25 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  30.88 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  33.08 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  30.77 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  34.65 
 
 		 245 aa  62  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  32.85 
 
 		 240 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  32.85 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  32.35 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  34.85 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  31.16 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  31.91 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1674  Ribonuclease III  35.46 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  30.71 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  33.85 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1196  ribonuclease III  32.58 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0711323  decreased coverage  0.00493903 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  32.58 
 
 		 240 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  32.61 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1402  ribonuclease III  34.81 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  32.61 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3071  ribonuclease III  32.61 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2785  ribonuclease III  32.61 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  33.33 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  33.33 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  28.47 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  32.12 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  31.47 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  32.35 
 
 		 229 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>