284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0304 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0304  ribonuclease III  100 
 
 		 154 aa  315  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.821127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1315  hypothetical protein  43.31 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0037  ribonuclease III  41.61 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2224  ribonuclease III  38.67 
 
 		 160 aa  90.1  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0167185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1116  ribonuclease III  36.49 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0608  ribonuclease III  33.33 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.815667  normal  0.533927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  32.56 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  33.83 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  33.58 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  36.51 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  33.08 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  33.08 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  33.58 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  33.08 
 
 		 237 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  34.11 
 
 		 236 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  32.31 
 
 		 248 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  36.43 
 
 		 271 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  33.77 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  34.59 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0570  ribonuclease III  34.13 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  33.83 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  35.51 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  35.34 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  33.83 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  33.58 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  34.35 
 
 		 246 aa  60.8  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  33.08 
 
 		 229 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  34.09 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  33.08 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1714  Ribonuclease III  32.24 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.61541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  30.23 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3081  ribonuclease III  31.65 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.569411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  34.97 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  29.14 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  32.54 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  33.08 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0659  ribonuclease III  27.48 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0117044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  34.97 
 
 		 383 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  34.11 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  33.08 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  31.82 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  33.08 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  34.11 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1565  ribonuclease III  31.54 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2170  ribonuclease III  33.85 
 
 		 406 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290031  normal  0.408262 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  31.82 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  33.33 
 
 		 385 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1196  ribonuclease III  33.33 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0711323  decreased coverage  0.00493903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  33.08 
 
 		 229 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  31.39 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  30.82 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  33.59 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  35.71 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  32.21 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02461  ribonuclease III  30.83 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1101  Ribonuclease III  30.83 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0115033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  29.1 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2722  ribonuclease III  30.83 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.444526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2720  ribonuclease III  30.83 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0115218  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  33.33 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0543  ribonuclease III  33.08 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1789  ribonuclease III  33.08 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2895  ribonuclease III  33.08 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1493  ribonuclease III  31.25 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000322958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2932  ribonuclease III  30.83 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.223981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2815  ribonuclease III  33.08 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  30.88 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2853  ribonuclease III  30.83 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0190873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1110  ribonuclease III  30.83 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2840  ribonuclease III  33.08 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3054  ribonuclease III  30.83 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255199  hitchhiker  0.00979275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3803  ribonuclease III  30.83 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  35.11 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02425  hypothetical protein  30.83 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  30.83 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2779  ribonuclease III  33.08 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  35.11 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2466  ribonuclease III  33.08 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  31.51 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4246  ribonuclease III  32.31 
 
 		 408 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  33.33 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  31.88 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  33.81 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  31.82 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  28.36 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1092  ribonuclease III  33.83 
 
 		 409 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  32.81 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  33.81 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  31.43 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  36 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2743  ribonuclease III  30.5 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  25.74 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2824  ribonuclease III  30.5 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2847  ribonuclease III  30.5 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0152776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  33.07 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2959  ribonuclease III  30.5 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  32.17 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1134  ribonuclease III  32.31 
 
 		 409 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  32.09 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  26.87 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>