237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3475 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3475  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  890    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0243076 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1802  AIR synthase related protein  71.56 
 
 		 440 aa  642    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1407  AIR synthase related protein  65.08 
 
 		 456 aa  568  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1060  AIR synthase related protein  55.45 
 
 		 439 aa  488  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.130176  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0826  AIR synthase related protein  55.43 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0488292  normal  0.413402 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1227  AIR synthase related protein  55.73 
 
 		 442 aa  481  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0846  cell division GTPase-like protein  55 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1879  AIR synthase related protein domain protein  53.99 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1302  AIR synthase related protein  51.88 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1294  AIR synthase-like protein  50.89 
 
 		 447 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0894  AIR synthase related protein  51.76 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0662  AIR synthase-like protein  50.44 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.758214  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1382  AIR synthase related protein  50.89 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2149  AIR synthase-like protein  41.72 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000105335  hitchhiker  0.000422525 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1056  AIR synthase related protein  40.86 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0908596  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  25.35 
 
 		 339 aa  67  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  28.52 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  27.73 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  29.8 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1667  AIR synthase-like protein  25.7 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  28.82 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  27.27 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  28.24 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  26.07 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  28.44 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  28.38 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  24.76 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  28.14 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  28.25 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  31.8 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  21.52 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  22.26 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  27.4 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.65 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  28.74 
 
 		 671 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  26.51 
 
 		 315 aa  57  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.82 
 
 		 351 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  25.91 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.76 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4785  selenophosphate synthase  27.39 
 
 		 767 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.211617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  28.82 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  24.38 
 
 		 320 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  24.22 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0203  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.55 
 
 		 343 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0139093  normal  0.0653049 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  28.03 
 
 		 348 aa  55.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  32.11 
 
 		 333 aa  54.7  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  26.27 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  25.42 
 
 		 323 aa  54.7  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  32.87 
 
 		 327 aa  53.9  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.93 
 
 		 355 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  31.61 
 
 		 325 aa  54.3  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.93 
 
 		 355 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.93 
 
 		 355 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1952  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.94 
 
 		 734 aa  53.9  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  26.46 
 
 		 357 aa  53.9  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0401  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.97 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.496763 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  22.22 
 
 		 345 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.78 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1613  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.47 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.112161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  22.68 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0501  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.84 
 
 		 341 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790164  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  28.38 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  28.24 
 
 		 351 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  22.22 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.47 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  25 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  24.26 
 
 		 327 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.59 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  25.82 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0391  AIR synthase related protein domain protein  24.28 
 
 		 340 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.271366  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2723  selenophosphate synthetase  23.95 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25471  selenide,water dikinase  23.1 
 
 		 730 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  25.11 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.03 
 
 		 750 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  26.18 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0506  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.93 
 
 		 341 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.777692  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  22.26 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0780  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.13 
 
 		 721 aa  51.6  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0313655 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  23.9 
 
 		 345 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  32 
 
 		 348 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  27.73 
 
 		 328 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  31.68 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  27.35 
 
 		 355 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  24.52 
 
 		 340 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2499  AIR synthase related protein domain protein  25.69 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00696097  normal  0.39351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  28.19 
 
 		 325 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.35 
 
 		 338 aa  50.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  22.71 
 
 		 338 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.09 
 
 		 348 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  28.68 
 
 		 314 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.68 
 
 		 334 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  25.45 
 
 		 325 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.88 
 
 		 350 aa  50.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  27.18 
 
 		 330 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  24.68 
 
 		 337 aa  50.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0515  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.02 
 
 		 340 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0993017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  25.63 
 
 		 348 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  26.71 
 
 		 335 aa  50.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.34 
 
 		 802 aa  50.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.28 
 
 		 331 aa  50.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>