239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1879 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1879  AIR synthase related protein domain protein  100 
 
 
443 aa  888    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0826  AIR synthase related protein  71.75 
 
 
441 aa  620  1e-176  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0488292  normal  0.413402 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1227  AIR synthase related protein  72.89 
 
 
442 aa  615  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0846  cell division GTPase-like protein  66.21 
 
 
438 aa  566  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1060  AIR synthase related protein  62.95 
 
 
439 aa  552  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.130176  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1802  AIR synthase related protein  57.82 
 
 
440 aa  485  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3475  hypothetical protein  53.99 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0243076 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1407  AIR synthase related protein  56.39 
 
 
456 aa  455  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1294  AIR synthase-like protein  49.89 
 
 
447 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0662  AIR synthase-like protein  49.89 
 
 
447 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.758214  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1302  AIR synthase related protein  50.11 
 
 
448 aa  424  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1382  AIR synthase related protein  49.67 
 
 
447 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0894  AIR synthase related protein  51.12 
 
 
450 aa  411  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2149  AIR synthase-like protein  40.55 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000105335  hitchhiker  0.000422525 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1056  AIR synthase related protein  38.32 
 
 
432 aa  294  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0908596  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  25.14 
 
 
339 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  25.42 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  28.75 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  30.83 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  26.46 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.48 
 
 
336 aa  67  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  28.84 
 
 
331 aa  67  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.33 
 
 
339 aa  63.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  24.15 
 
 
338 aa  63.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  29.08 
 
 
355 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  28.75 
 
 
351 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1413  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.56 
 
 
331 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0720065  normal  0.131563 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2499  AIR synthase related protein domain protein  28.89 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00696097  normal  0.39351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.44 
 
 
351 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0465  AIR synthase related protein domain protein  27.14 
 
 
345 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0401  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.3 
 
 
366 aa  58.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.496763 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  27.03 
 
 
342 aa  57.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.73 
 
 
334 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0203  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.34 
 
 
343 aa  57.4  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0139093  normal  0.0653049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  31.25 
 
 
369 aa  56.6  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  23.87 
 
 
326 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  24.82 
 
 
347 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.62 
 
 
334 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.23 
 
 
331 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  27.69 
 
 
351 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.62 
 
 
345 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  26.69 
 
 
332 aa  55.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1186  AIR synthase-like protein  25.09 
 
 
304 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  28.09 
 
 
354 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.11 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.84 
 
 
723 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.34 
 
 
334 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.04 
 
 
334 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1281  AIR synthase related protein domain protein  27.92 
 
 
345 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3233  AIR synthase related protein domain protein  28.71 
 
 
346 aa  53.9  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  25.32 
 
 
328 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  25.31 
 
 
345 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.55 
 
 
331 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  31.86 
 
 
349 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  25.41 
 
 
325 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1613  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.34 
 
 
353 aa  53.5  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.112161  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  29.05 
 
 
378 aa  53.5  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  25.59 
 
 
323 aa  53.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3716  selenophosphate synthetase  26.88 
 
 
351 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1959  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.74 
 
 
727 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0119456  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  25.55 
 
 
353 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  28.32 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  25.99 
 
 
354 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  27.1 
 
 
353 aa  52.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  29.73 
 
 
347 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  25.68 
 
 
335 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  29.34 
 
 
357 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  31.39 
 
 
316 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.12 
 
 
370 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  31.22 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  30.49 
 
 
359 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  34.12 
 
 
343 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  29.37 
 
 
351 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1568  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.79 
 
 
339 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  28.51 
 
 
327 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  28.12 
 
 
348 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  29.09 
 
 
340 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  24.62 
 
 
330 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  25.21 
 
 
320 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  28.1 
 
 
325 aa  50.4  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  26.52 
 
 
330 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  25.19 
 
 
357 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25471  selenide,water dikinase  26.09 
 
 
730 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0146  AIR synthase-like protein  26.48 
 
 
335 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.592011  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  23.81 
 
 
337 aa  50.1  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.32 
 
 
348 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.17 
 
 
804 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.327511  hitchhiker  0.00549488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.25 
 
 
331 aa  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  27.32 
 
 
319 aa  49.7  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0137  AIR synthase-like protein  26.62 
 
 
326 aa  49.7  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.073197 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  27.62 
 
 
354 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.42 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3350  selenide, water dikinase  26.11 
 
 
709 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  28.16 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.08 
 
 
336 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  29.24 
 
 
343 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1097  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.44 
 
 
599 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000033132  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3450  selenophosphate synthetase  26.56 
 
 
351 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111292  normal  0.645552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  28.97 
 
 
671 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  23.53 
 
 
328 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>