282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0955 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  100 
 
 
332 aa  669    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0522  AIR synthase related protein domain protein  71.3 
 
 
341 aa  481  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.298857  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0465  AIR synthase related protein domain protein  43.71 
 
 
345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1340  AIR synthase-like protein  41 
 
 
357 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0251507  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1592  AIR synthase domain-containing protein  41 
 
 
357 aa  279  6e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0242218  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1476  AIR synthase domain protein  39.53 
 
 
359 aa  276  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332948  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3233  AIR synthase related protein domain protein  39.41 
 
 
346 aa  249  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  38.14 
 
 
335 aa  240  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1281  AIR synthase related protein domain protein  35.57 
 
 
345 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  36.5 
 
 
345 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0391  AIR synthase related protein domain protein  34.71 
 
 
340 aa  209  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.271366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  35.61 
 
 
528 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1667  AIR synthase-like protein  31.86 
 
 
335 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  31.6 
 
 
331 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  30.45 
 
 
348 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0960  AIR synthase-like protein  31.33 
 
 
337 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  27.66 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  28.27 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  27.9 
 
 
325 aa  136  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0137  AIR synthase-like protein  30.51 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.073197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1186  AIR synthase-like protein  30.72 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  30.12 
 
 
323 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0146  AIR synthase-like protein  27.54 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.592011  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2499  AIR synthase related protein domain protein  28.53 
 
 
330 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00696097  normal  0.39351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2063  AIR synthase-like protein  27.99 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2909  AIR synthase related protein domain protein  26.2 
 
 
326 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1057  AIR synthase related protein domain protein  25 
 
 
330 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  29.26 
 
 
326 aa  99.4  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1037  AIR synthase related protein domain protein  24.4 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.76 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1669  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.27 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.38 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  27.48 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.03 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6175  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.07 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0950087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  25.78 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.67 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.47 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.15 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.2 
 
 
334 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  23.92 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1277  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.81 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.07 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.16 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  26.43 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0390  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.95 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.117934  hitchhiker  0.0000000437188 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1386  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.32 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.460156  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.65 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1095  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.59 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.23 
 
 
334 aa  63.5  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  22.76 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.16 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.62 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.2 
 
 
336 aa  62.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.61 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.62 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.17 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1676  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.92 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.831049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.05 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.57 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.01 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.64 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.57 
 
 
352 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00353  Hydrogenase expression/formation protein HypE  24.19 
 
 
350 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  25.85 
 
 
347 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.58 
 
 
338 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  27.73 
 
 
334 aa  59.3  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1056  AIR synthase related protein  26.28 
 
 
432 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0908596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.05 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.08 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.53 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.42 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  25 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.07 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.89 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  22.73 
 
 
348 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  22.73 
 
 
348 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0894  AIR synthase related protein  26.54 
 
 
450 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.91 
 
 
337 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.15 
 
 
330 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.08 
 
 
345 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.08 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.35 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1407  AIR synthase related protein  24.57 
 
 
456 aa  57  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.63 
 
 
342 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.74 
 
 
352 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3314  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.63 
 
 
342 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.26 
 
 
354 aa  56.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0684  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.82 
 
 
334 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.76 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  22.29 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1879  AIR synthase related protein domain protein  26.69 
 
 
443 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.09 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.82 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.83 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02545  hypothetical protein  23.83 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.83 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1294  AIR synthase-like protein  24.64 
 
 
447 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  22.6 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  23.97 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>