More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7579 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  100 
 
 		 328 aa  652    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  66.25 
 
 		 323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  58.13 
 
 		 331 aa  342  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  57.37 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  56.25 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  54.52 
 
 		 332 aa  332  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  54.6 
 
 		 327 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  55.06 
 
 		 327 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  52.47 
 
 		 328 aa  328  6e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  53.87 
 
 		 341 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  54.55 
 
 		 342 aa  325  9e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  60.14 
 
 		 331 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  54.29 
 
 		 334 aa  276  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  43.75 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  42.38 
 
 		 338 aa  219  7e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  38.39 
 
 		 326 aa  209  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  35.85 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  36.02 
 
 		 333 aa  199  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  37.97 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  34.36 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  33.12 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  36.57 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  33.01 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  32.83 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  32.71 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  33.12 
 
 		 323 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  31.78 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  31.53 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  30.61 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  39.82 
 
 		 486 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  37.67 
 
 		 481 aa  139  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  39.57 
 
 		 471 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  28.02 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  29.47 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  30.57 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1407  AIR synthase related protein  26.97 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  35.12 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  29.71 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  28.06 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  24.92 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  24.61 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  28.05 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1802  AIR synthase related protein  23.19 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  27.27 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1773  AIR synthase-like protein  25.42 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  31.92 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1097  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.19 
 
 		 599 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000033132  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0846  cell division GTPase-like protein  23.81 
 
 		 438 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0087  AIR synthase-like protein  24.77 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  28.27 
 
 		 528 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0038  AIR synthase related protein  23.64 
 
 		 293 aa  62  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0130  AIR synthase-like protein  26.8 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.633994  normal  0.0459155 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.03 
 
 		 730 aa  60.5  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2909  AIR synthase related protein domain protein  27.82 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0640  AIR synthase related protein domain protein  24.45 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221872  normal  0.692624 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0690  AIR synthase-like protein  26.8 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10679  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  28.24 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3475  hypothetical protein  21.52 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0243076 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.58 
 
 		 717 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  26.12 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  32.84 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  27.92 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  26.72 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  21.53 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1966  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.24 
 
 		 731 aa  56.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  27.82 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2063  AIR synthase-like protein  32.99 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.51 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  29.2 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  25.8 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  25.08 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  28.19 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  25.89 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  27.33 
 
 		 355 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  29.65 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2051  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.83 
 
 		 715 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00206417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  32.49 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  29.11 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  25.85 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1236  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.13 
 
 		 590 aa  53.5  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  26.35 
 
 		 348 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  31.62 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  23.26 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  30.51 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  27.57 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  29.03 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1227  AIR synthase related protein  26.67 
 
 		 442 aa  52.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  29.13 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.92 
 
 		 758 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  25.17 
 
 		 727 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  28.12 
 
 		 355 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.16 
 
 		 779 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  30.71 
 
 		 349 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.49 
 
 		 779 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.38 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  29.45 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  29.45 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  29.45 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  29.36 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>