246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5396 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  100 
 
 		 331 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  88.31 
 
 		 331 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  85.5 
 
 		 331 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  59.63 
 
 		 342 aa  362  6e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  62.31 
 
 		 323 aa  358  6e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  59.13 
 
 		 328 aa  358  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  57.76 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  57.75 
 
 		 332 aa  355  8.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  59.87 
 
 		 341 aa  354  8.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  56.78 
 
 		 327 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  57.85 
 
 		 328 aa  342  7e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  58.13 
 
 		 328 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  51.34 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  41.4 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  47.01 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  34.27 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  36.73 
 
 		 336 aa  199  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  36.28 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  36.42 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  33.23 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  37.15 
 
 		 321 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  34.69 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  30.77 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  32.92 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  33.03 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  33.33 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  33.43 
 
 		 327 aa  175  9e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  32.22 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  31.48 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 		 479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  36.8 
 
 		 486 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  33.76 
 
 		 481 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  35.09 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  34.44 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  33.12 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  30.45 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  34.86 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  28.38 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  31.68 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  30.91 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  27.51 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  33.63 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  29.8 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2509  thiamine-monophosphate kinase  35.26 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0452713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  33.03 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  26.25 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  27.18 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  28.91 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  28.04 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  34.05 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  27.96 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  34.59 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  32.38 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  27.65 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  25.75 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  26.67 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  34.25 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  25.75 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  30.49 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  29.18 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  27.6 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  27.93 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  25.42 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  27.33 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  27.6 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  22.68 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.63 
 
 		 781 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  25.42 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  30.84 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  26.9 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  27.03 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  27.97 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  30.64 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  32.61 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  33.04 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  33.04 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  26.78 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  27.03 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  25.42 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  37.01 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25 
 
 		 741 aa  56.2  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  30.25 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  32.02 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  34.91 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  32.64 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  30.14 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  29.54 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  33.19 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  34.91 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  25.1 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  30.21 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.31 
 
 		 716 aa  53.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.191388  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  29.77 
 
 		 361 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  34.4 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  31.91 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  25.96 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  29.91 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  33.78 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>