More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4564 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  100 
 
 		 328 aa  653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  77.19 
 
 		 327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  74.69 
 
 		 327 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  66.46 
 
 		 332 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  61.68 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  61.95 
 
 		 341 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  59.13 
 
 		 331 aa  358  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  57.59 
 
 		 331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  58.51 
 
 		 331 aa  339  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  56.25 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  54.18 
 
 		 328 aa  333  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  51.39 
 
 		 323 aa  319  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  61.48 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  42.55 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  40.32 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  41.04 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  36.64 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  36.96 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  38.72 
 
 		 336 aa  192  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  35.46 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  37.19 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  34.45 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  31.69 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  31.69 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  29.45 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  31.6 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  31.71 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  31.29 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  30.06 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  34.71 
 
 		 486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 		 479 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  33.92 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  34.35 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  34.23 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  29.37 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  30.79 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  28.94 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  29.31 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  27.67 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  29.41 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  31.62 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  29.86 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.64 
 
 		 779 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.49 
 
 		 779 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  33.15 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  27.69 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1097  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.04 
 
 		 599 aa  63.2  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000033132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  30.38 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  31.29 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  27.51 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  30.07 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  27.83 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  27.42 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  31.58 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  30.73 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  31.58 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  32.29 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.32 
 
 		 779 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.494756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  30 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  28.44 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  30 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  20.49 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  31.42 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.55 
 
 		 779 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  26.96 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  31.08 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  33.07 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  27.53 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3461  AIR synthase related protein-like  30.71 
 
 		 717 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  32.05 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  32.28 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  26.77 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  31.88 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  31.91 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  28.92 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  26.44 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  38.81 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  26.21 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.42 
 
 		 716 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.191388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  31.72 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0640  AIR synthase related protein domain protein  23.11 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221872  normal  0.692624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  26.14 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  27.68 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  29.81 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  31.3 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1959  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.37 
 
 		 727 aa  55.8  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0119456  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  28.42 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  35.29 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  26.94 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  24.72 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  29.79 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4320  thiamine-monophosphate kinase  39.1 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.267415  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  34.53 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  31.22 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1966  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.08 
 
 		 731 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  32.87 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  31.22 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  32.08 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  32.62 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>