More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3509 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  99.15 
 
 
351 aa  667    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  100 
 
 
355 aa  683    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  96.18 
 
 
314 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  77.78 
 
 
316 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  53.33 
 
 
347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  52.78 
 
 
328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  49.23 
 
 
347 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  45.92 
 
 
343 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  45.92 
 
 
343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  46.96 
 
 
344 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  43.07 
 
 
342 aa  297  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  51.46 
 
 
309 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  47.65 
 
 
360 aa  292  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  48.44 
 
 
354 aa  288  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  50.16 
 
 
328 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  47.98 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  47.69 
 
 
356 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  51.02 
 
 
345 aa  286  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  46.75 
 
 
357 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  49.5 
 
 
323 aa  286  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  51.59 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  53.29 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  44.25 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  45.82 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  48.96 
 
 
343 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  47.19 
 
 
357 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  47.19 
 
 
357 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  47.19 
 
 
357 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  49.22 
 
 
320 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  46.58 
 
 
348 aa  279  6e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  47.99 
 
 
354 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  47.99 
 
 
354 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  47.52 
 
 
354 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  46.48 
 
 
354 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  47.99 
 
 
356 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  47.7 
 
 
421 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  47.7 
 
 
385 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  43.02 
 
 
352 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  44.7 
 
 
347 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  46.91 
 
 
357 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  43.71 
 
 
351 aa  276  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  51.44 
 
 
317 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  47.7 
 
 
356 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  49.55 
 
 
350 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  44.18 
 
 
352 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  47.32 
 
 
389 aa  275  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  44.18 
 
 
352 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  44.18 
 
 
352 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  44.18 
 
 
352 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  42.82 
 
 
346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  44.15 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  46.35 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  52.11 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  45.06 
 
 
348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  42.73 
 
 
352 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  43.2 
 
 
346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  42.73 
 
 
352 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  45.53 
 
 
671 aa  272  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  41.91 
 
 
351 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  48.21 
 
 
351 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  46.38 
 
 
359 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  43.54 
 
 
352 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  44.48 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  44.25 
 
 
347 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  44.25 
 
 
347 aa  269  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  44.25 
 
 
347 aa  269  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  47.18 
 
 
346 aa  269  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  44.25 
 
 
347 aa  269  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  44.25 
 
 
347 aa  269  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  44.25 
 
 
347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  46.51 
 
 
353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  47.04 
 
 
347 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  44.25 
 
 
347 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  44.25 
 
 
347 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  44.25 
 
 
347 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  44.03 
 
 
352 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  44.97 
 
 
355 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04230  selenophosphate synthase  53.9 
 
 
357 aa  267  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776099  normal  0.124051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3578  selenide, water dikinase  49.5 
 
 
331 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.319488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  42.26 
 
 
347 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  49.84 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  43.52 
 
 
359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  43.49 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  46.42 
 
 
362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  47.11 
 
 
389 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  46.08 
 
 
352 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  46.71 
 
 
345 aa  266  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  49.36 
 
 
317 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  43.59 
 
 
348 aa  265  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  43.59 
 
 
348 aa  265  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  43.58 
 
 
358 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  45.06 
 
 
355 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  49.2 
 
 
344 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  45.83 
 
 
347 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  45.83 
 
 
347 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  43.59 
 
 
348 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  45.83 
 
 
347 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  45.83 
 
 
347 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  45.83 
 
 
347 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  47.52 
 
 
348 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>