More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6662 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
486 aa  945    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  58.92 
 
 
479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  57.17 
 
 
481 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  56.84 
 
 
471 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  40.36 
 
 
323 aa  150  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  39.83 
 
 
325 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  39.82 
 
 
328 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  34.76 
 
 
326 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  40.97 
 
 
328 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  37.33 
 
 
341 aa  136  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  38.46 
 
 
342 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  35.81 
 
 
338 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  40.26 
 
 
331 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  35.71 
 
 
330 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  34.91 
 
 
321 aa  131  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  34.71 
 
 
328 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  27.78 
 
 
324 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  36.8 
 
 
331 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  36.7 
 
 
338 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  36.16 
 
 
333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  35.84 
 
 
332 aa  128  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  33.07 
 
 
336 aa  128  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  37.66 
 
 
331 aa  127  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  34.5 
 
 
331 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  35.53 
 
 
334 aa  123  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  34.53 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  34.08 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  30.18 
 
 
326 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  31.73 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  29.01 
 
 
331 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  31.33 
 
 
323 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  30.92 
 
 
327 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  32.43 
 
 
323 aa  108  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  38.56 
 
 
185 aa  91.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442878  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3476  hypothetical protein  37.91 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2713  GCN5-related N-acetyltransferase  39.44 
 
 
203 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5395  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
181 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  39.71 
 
 
186 aa  77  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1410  hypothetical protein  38.73 
 
 
201 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4563  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
187 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220233  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0058  GCN5-related N-acetyltransferase  38.12 
 
 
180 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23701  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2621  GCN5-related N-acetyltransferase  36.65 
 
 
196 aa  72.4  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  37.16 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1530  thiamine-monophosphate kinase  29.93 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160353  normal  0.929464 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1031  thiamine monophosphate kinase  27.38 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.7438  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0837  hypothetical protein  37.06 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0565893  normal  0.217195 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13151  hypothetical protein  32.17 
 
 
217 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.197683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  32.27 
 
 
323 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0247  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 
180 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293456  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1994  GCN5-related N-acetyltransferase  36.76 
 
 
179 aa  63.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  35.29 
 
 
315 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  34.12 
 
 
328 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.82 
 
 
344 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  36.75 
 
 
332 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  28.8 
 
 
329 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  29.65 
 
 
323 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  32.27 
 
 
324 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  24.57 
 
 
325 aa  60.1  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  33.66 
 
 
315 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  32.41 
 
 
335 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  29.2 
 
 
318 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  32.57 
 
 
332 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  27.21 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  31.25 
 
 
344 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  32.41 
 
 
325 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  30.69 
 
 
327 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 
181 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279327  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  31.02 
 
 
339 aa  58.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  28.76 
 
 
318 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  30 
 
 
333 aa  58.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  23.71 
 
 
331 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  30.26 
 
 
321 aa  58.2  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1110  hypothetical protein  34.23 
 
 
222 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.379383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  28.76 
 
 
318 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  27.45 
 
 
328 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  35.15 
 
 
329 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  27.97 
 
 
346 aa  57.4  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  33.19 
 
 
324 aa  57  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  28.32 
 
 
323 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  28.32 
 
 
323 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  33.63 
 
 
334 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  28.32 
 
 
323 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  30.15 
 
 
315 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  28.32 
 
 
323 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4320  thiamine-monophosphate kinase  35.77 
 
 
329 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.267415  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  30.6 
 
 
315 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  34.18 
 
 
325 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  35 
 
 
340 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  31.31 
 
 
316 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  32.52 
 
 
319 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  32.39 
 
 
300 aa  55.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  33.19 
 
 
333 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  30.57 
 
 
325 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  35.04 
 
 
329 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  33.19 
 
 
333 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  33.19 
 
 
333 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  30.25 
 
 
319 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  33.19 
 
 
333 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  33.19 
 
 
333 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  31.88 
 
 
320 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>