28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3476 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3476  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  400  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  67.55 
 
 		 185 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442878  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4563  GCN5-related N-acetyltransferase  64.09 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220233  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1410  hypothetical protein  63.22 
 
 		 201 aa  214  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  59.02 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2713  GCN5-related N-acetyltransferase  61.36 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0058  GCN5-related N-acetyltransferase  58.24 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23701  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0247  GCN5-related N-acetyltransferase  57.46 
 
 		 180 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5395  GCN5-related N-acetyltransferase  58.29 
 
 		 181 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7578  GCN5 family N-acetyltransferase  51.93 
 
 		 180 aa  164  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2621  GCN5-related N-acetyltransferase  52.76 
 
 		 196 aa  158  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1994  GCN5-related N-acetyltransferase  52.57 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  43.31 
 
 		 181 aa  117  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0837  hypothetical protein  47.14 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0565893  normal  0.217195 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13151  hypothetical protein  42.14 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.197683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1110  hypothetical protein  40.54 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.379383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 		 479 aa  78.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  37.91 
 
 		 486 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  36.18 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  33.97 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 		 288 aa  48.9  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2022  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0535871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2404  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0613463 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 		 145 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28400  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 141 aa  42.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3600  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 		 141 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2788  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 		 138 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1127  acetyltransferase  32.87 
 
 		 138 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>