32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1410 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1410  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2713  GCN5-related N-acetyltransferase  89.66 
 
 
203 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4563  GCN5-related N-acetyltransferase  70.41 
 
 
187 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220233  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  65.24 
 
 
185 aa  223  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442878  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3476  hypothetical protein  62.71 
 
 
195 aa  214  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  62.35 
 
 
186 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5395  GCN5-related N-acetyltransferase  57.4 
 
 
181 aa  184  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0058  GCN5-related N-acetyltransferase  55.23 
 
 
180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23701  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7578  GCN5 family N-acetyltransferase  56 
 
 
180 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2621  GCN5-related N-acetyltransferase  54.27 
 
 
196 aa  175  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0247  GCN5-related N-acetyltransferase  53.25 
 
 
180 aa  168  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293456  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1994  GCN5-related N-acetyltransferase  53.57 
 
 
179 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  48.18 
 
 
181 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279327  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0837  hypothetical protein  48.15 
 
 
210 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0565893  normal  0.217195 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13151  hypothetical protein  44.03 
 
 
217 aa  121  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.197683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1110  hypothetical protein  39.66 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.379383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 
486 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  38.06 
 
 
479 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  36.76 
 
 
471 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
145 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2022  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
144 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0535871  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5884  GCN5-related N-acetyltransferase  35.54 
 
 
143 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  34.53 
 
 
481 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1330  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0879736  normal  0.150143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3245  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 
142 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
159 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
143 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0042  acetyltransferase  25.96 
 
 
146 aa  42  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28400  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
141 aa  41.6  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>