43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2102 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
185 aa  383  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442878  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3476  hypothetical protein  67.55 
 
 
195 aa  258  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4563  GCN5-related N-acetyltransferase  62.43 
 
 
187 aa  231  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220233  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2713  GCN5-related N-acetyltransferase  63.53 
 
 
203 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1410  hypothetical protein  65.24 
 
 
201 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  59.55 
 
 
186 aa  210  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5395  GCN5-related N-acetyltransferase  60.47 
 
 
181 aa  201  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0058  GCN5-related N-acetyltransferase  60.61 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23701  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0247  GCN5-related N-acetyltransferase  57.31 
 
 
180 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293456  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7578  GCN5 family N-acetyltransferase  56.73 
 
 
180 aa  184  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1994  GCN5-related N-acetyltransferase  53.11 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2621  GCN5-related N-acetyltransferase  54.84 
 
 
196 aa  170  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13151  hypothetical protein  45.52 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.197683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
181 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279327  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0837  hypothetical protein  48.89 
 
 
210 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0565893  normal  0.217195 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1110  hypothetical protein  42.76 
 
 
222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.379383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  38.56 
 
 
486 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  41.3 
 
 
479 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  36.24 
 
 
471 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  34.44 
 
 
481 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  32.85 
 
 
289 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2022  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
144 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0535871  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1127  acetyltransferase  34.78 
 
 
138 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2788  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
138 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349423  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
145 aa  47.8  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2404  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0613463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
287 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28400  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
141 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
287 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  33.94 
 
 
287 aa  45.1  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 
144 aa  45.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.268987  normal  0.639753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
287 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
288 aa  44.7  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0049  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
138 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
292 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3600  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
141 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189095  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5884  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0919  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.441761  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  32.23 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  32.23 
 
 
147 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
147 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3245  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
142 aa  41.2  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380354  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1295  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
164 aa  41.2  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>