35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0559 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 186 aa  383  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4563  GCN5-related N-acetyltransferase  61.17 
 
 		 187 aa  224  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220233  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3476  hypothetical protein  59.02 
 
 		 195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1410  hypothetical protein  62.35 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  59.55 
 
 		 185 aa  210  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442878  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2713  GCN5-related N-acetyltransferase  63.47 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5395  GCN5-related N-acetyltransferase  59.41 
 
 		 181 aa  191  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0058  GCN5-related N-acetyltransferase  55.75 
 
 		 180 aa  178  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23701  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0247  GCN5-related N-acetyltransferase  56.47 
 
 		 180 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7578  GCN5 family N-acetyltransferase  59.04 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2621  GCN5-related N-acetyltransferase  54.27 
 
 		 196 aa  164  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1994  GCN5-related N-acetyltransferase  51.5 
 
 		 179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0837  hypothetical protein  49.26 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0565893  normal  0.217195 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13151  hypothetical protein  43.07 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.197683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  43.26 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1110  hypothetical protein  42.76 
 
 		 222 aa  111  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.379383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  41.91 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  39.71 
 
 		 486 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  40.46 
 
 		 471 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  36.84 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1330  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0879736  normal  0.150143 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 		 138 aa  51.2  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1383  acyltransferase-like protein  30.91 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2022  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0535871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  27.39 
 
 		 147 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164385  normal  0.0598732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1085  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  29.73 
 
 		 201 aa  42  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5884  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 		 143 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1634  acetyltransferase  28.07 
 
 		 146 aa  41.2  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.927882 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0042  acetyltransferase  26.96 
 
 		 146 aa  41.2  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 		 289 aa  41.2  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>