More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1987 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  100 
 
 		 319 aa  633  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  60.69 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  51.91 
 
 		 347 aa  311  6.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  51.96 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  52.34 
 
 		 328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  51.77 
 
 		 347 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  54.05 
 
 		 309 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  53.47 
 
 		 317 aa  296  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  50.47 
 
 		 316 aa  288  6e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  49.66 
 
 		 323 aa  288  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  51.17 
 
 		 351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  46.28 
 
 		 342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  51.51 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  48.55 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  45.66 
 
 		 343 aa  275  9e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  48.73 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  45.16 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  50 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  50.7 
 
 		 317 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  48.94 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  50 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  46.77 
 
 		 316 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  45.72 
 
 		 352 aa  262  4.999999999999999e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  48.67 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  50.34 
 
 		 343 aa  262  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  47.08 
 
 		 348 aa  261  8e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  48.59 
 
 		 327 aa  261  8.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  48.59 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  47.54 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  47.16 
 
 		 340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  45.98 
 
 		 359 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  51.88 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  45.54 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  44.51 
 
 		 357 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  48.25 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  44.51 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  44.38 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  41.42 
 
 		 358 aa  249  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  45.49 
 
 		 360 aa  248  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  47.04 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  44.84 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  43.57 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  43.57 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  43.57 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  44.52 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  46 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  47.19 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  42.95 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  43.95 
 
 		 344 aa  242  5e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  47.46 
 
 		 346 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  42.18 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  43.85 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0583  selenide, water dikinase  49.64 
 
 		 337 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  43.22 
 
 		 389 aa  238  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  43.77 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  43.22 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  43.22 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  43.22 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  42.41 
 
 		 346 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  41.59 
 
 		 352 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  41.9 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  43.45 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  45.34 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  42.9 
 
 		 356 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  42.9 
 
 		 385 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  41.59 
 
 		 352 aa  235  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  51.08 
 
 		 291 aa  235  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  45.33 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  42.63 
 
 		 421 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  43.3 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  46.1 
 
 		 348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  43.3 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  43.3 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  41.57 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  43.93 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  41.27 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  42.81 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6596  selenide, water dikinase  48.85 
 
 		 381 aa  232  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  42.48 
 
 		 671 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  42.95 
 
 		 357 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  43.09 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  41.61 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  42.9 
 
 		 357 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  42.44 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  41.94 
 
 		 352 aa  228  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  44.16 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3578  selenide, water dikinase  47.89 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.319488  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  48.47 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  40.75 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  40.61 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  42.14 
 
 		 359 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  43.64 
 
 		 352 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  43.21 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  48.71 
 
 		 335 aa  225  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  43.27 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  44.37 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  38.8 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  40.61 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  43.09 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  43.09 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>