283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0252 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  100 
 
 		 352 aa  719    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  51.02 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  47.89 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  48.19 
 
 		 343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  47.29 
 
 		 347 aa  308  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  46.02 
 
 		 342 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  46.27 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  47.76 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  50.16 
 
 		 328 aa  289  6e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  47.68 
 
 		 309 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  46.93 
 
 		 347 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  44.61 
 
 		 340 aa  278  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  47.99 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  42.35 
 
 		 354 aa  275  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  46.36 
 
 		 327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  45.79 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  48.54 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  47.93 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  42.64 
 
 		 344 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  43.11 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  44.03 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  42.18 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  46.18 
 
 		 316 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  41.94 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  45.55 
 
 		 317 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  41.96 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  42.65 
 
 		 352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  44.65 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  42.65 
 
 		 352 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  45.71 
 
 		 351 aa  252  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  42.65 
 
 		 352 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  44.05 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  43.19 
 
 		 671 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  41.89 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  41.74 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  41.42 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  43.31 
 
 		 358 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  42.35 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  42.73 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  41.79 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  47.37 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  45.17 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  42.2 
 
 		 352 aa  249  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  42.41 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  47.6 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  42.98 
 
 		 343 aa  248  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  39.47 
 
 		 358 aa  248  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  43.31 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  41.18 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  41 
 
 		 346 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  43.83 
 
 		 360 aa  242  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  41.37 
 
 		 352 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  46.21 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  42.86 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  43.17 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  48.85 
 
 		 291 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  43.43 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  45.08 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  42.27 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  45.72 
 
 		 319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  43.18 
 
 		 352 aa  239  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  42.55 
 
 		 351 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  40.75 
 
 		 354 aa  236  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  40.06 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  43.12 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  43.12 
 
 		 356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  43.12 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  43.34 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  42.68 
 
 		 421 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  42.81 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  41.92 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  42.68 
 
 		 385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  41.92 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  41.35 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  39.77 
 
 		 353 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  41.07 
 
 		 359 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2723  selenophosphate synthetase  43.03 
 
 		 347 aa  232  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  41.32 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  41.32 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  41.32 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  41.06 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  41.85 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  39.09 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  41.62 
 
 		 357 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  46.05 
 
 		 316 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  42.77 
 
 		 355 aa  228  8e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  41.87 
 
 		 389 aa  228  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  42.39 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  43.87 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  42.39 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  42.11 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  42.39 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  42.39 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  42.39 
 
 		 347 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  41.61 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  42.11 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  42.39 
 
 		 347 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  42.24 
 
 		 344 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  42.39 
 
 		 347 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  40.41 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>