More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3849 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  100 
 
 		 317 aa  627  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  71.29 
 
 		 343 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  73.19 
 
 		 345 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  69.18 
 
 		 343 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  67.54 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  65.23 
 
 		 326 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  61.2 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  50.81 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  48.23 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  46.35 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  50.32 
 
 		 347 aa  286  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  52.98 
 
 		 348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  52.16 
 
 		 328 aa  279  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  48.05 
 
 		 315 aa  279  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  46.98 
 
 		 323 aa  278  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  49.68 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  45.31 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  46.44 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  44.44 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  54.09 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  50 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  50 
 
 		 350 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  47.34 
 
 		 344 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  49.36 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  43.75 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  49.36 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  44.19 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  48 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  46.79 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  44.87 
 
 		 344 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  45.55 
 
 		 352 aa  255  8e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  45.93 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  51.45 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  46.47 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  44.55 
 
 		 344 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  44.23 
 
 		 344 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  45.95 
 
 		 354 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  45.83 
 
 		 344 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  44.69 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  44.7 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  44.7 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  46.59 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  44.7 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  44.7 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  44.7 
 
 		 347 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  44.69 
 
 		 348 aa  249  4e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  44.7 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  44.72 
 
 		 327 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  46.67 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  44.7 
 
 		 347 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4363  selenophosphate synthetase  44.37 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.040516  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  46.3 
 
 		 344 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  44.7 
 
 		 347 aa  248  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  44.37 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  45.19 
 
 		 345 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  47.47 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  47.47 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  47.47 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  47.59 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  47.14 
 
 		 356 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  47.14 
 
 		 385 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  48.06 
 
 		 358 aa  245  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  42.31 
 
 		 351 aa  245  9e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  47.14 
 
 		 421 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  45.66 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  47.49 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  46.46 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  46.46 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  48.06 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  44.71 
 
 		 378 aa  242  7e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  44.87 
 
 		 321 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  46.71 
 
 		 671 aa  241  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  44.9 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  43.71 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  42.9 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  47.27 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  45.14 
 
 		 297 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  43.88 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  45.79 
 
 		 357 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  46.35 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  45.79 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  45.79 
 
 		 357 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  43.27 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  41.94 
 
 		 344 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  48.29 
 
 		 360 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  47.08 
 
 		 352 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  46.35 
 
 		 352 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  47.54 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  45.36 
 
 		 357 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  44.3 
 
 		 347 aa  238  8e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  46 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  45.79 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  46.95 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  46.71 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3755  selenophosphate synthetase  44.37 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  43.24 
 
 		 351 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  46.33 
 
 		 357 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  44.63 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  46.81 
 
 		 352 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  45.62 
 
 		 352 aa  235  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>