More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3076 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  100 
 
 
347 aa  700    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  59.46 
 
 
347 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  57.73 
 
 
343 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  58.09 
 
 
343 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  58.5 
 
 
309 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  56.47 
 
 
328 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  48.36 
 
 
342 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  50.15 
 
 
348 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  54.04 
 
 
315 aa  323  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  49.13 
 
 
354 aa  322  5e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  53.23 
 
 
328 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  57.53 
 
 
317 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  50.49 
 
 
323 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  52.23 
 
 
326 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  50.3 
 
 
343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  49.54 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  50.95 
 
 
340 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  50 
 
 
316 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  53.54 
 
 
345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  48.53 
 
 
343 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  51.28 
 
 
346 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  49.1 
 
 
343 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  49.23 
 
 
355 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  47.31 
 
 
344 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  49.55 
 
 
354 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  46.59 
 
 
355 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  46.41 
 
 
356 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  48.29 
 
 
327 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  45.24 
 
 
354 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  46.41 
 
 
356 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  45.24 
 
 
356 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  45.24 
 
 
354 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  45.77 
 
 
348 aa  289  4e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  48.23 
 
 
317 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  44.94 
 
 
356 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  45.97 
 
 
354 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  45.54 
 
 
357 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  45.97 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  44.83 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  45.37 
 
 
354 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  45.37 
 
 
357 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  45.37 
 
 
357 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  46.93 
 
 
352 aa  286  5e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  44.78 
 
 
357 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  44.91 
 
 
421 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  45.95 
 
 
369 aa  285  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  44.91 
 
 
385 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  45.07 
 
 
357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  44.48 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  45.97 
 
 
671 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  48.88 
 
 
316 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  47.13 
 
 
357 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  46.71 
 
 
344 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  44.12 
 
 
358 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  51.45 
 
 
319 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  47.1 
 
 
351 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  46.33 
 
 
343 aa  281  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  46.73 
 
 
389 aa  280  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  49.66 
 
 
314 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  44.12 
 
 
354 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  43.49 
 
 
353 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  44.19 
 
 
354 aa  276  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  46.95 
 
 
340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  44.28 
 
 
357 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  49.01 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  44.64 
 
 
351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  44.58 
 
 
351 aa  272  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  48.45 
 
 
318 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  44.68 
 
 
346 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3716  selenophosphate synthetase  45.35 
 
 
351 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  46.43 
 
 
351 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  43.36 
 
 
353 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  43.67 
 
 
359 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  44.07 
 
 
347 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3450  selenophosphate synthetase  45.05 
 
 
351 aa  268  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111292  normal  0.645552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  43.27 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  45.54 
 
 
351 aa  266  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  43.52 
 
 
358 aa  266  5e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  42.86 
 
 
355 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  43.87 
 
 
352 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  43.77 
 
 
352 aa  262  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  45.18 
 
 
350 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  44.38 
 
 
347 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  44.07 
 
 
351 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  44.81 
 
 
359 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  43.52 
 
 
352 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  46.71 
 
 
321 aa  259  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  44.59 
 
 
314 aa  258  8e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.592311 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  43.82 
 
 
347 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  43.82 
 
 
347 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  43.82 
 
 
347 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  43.82 
 
 
347 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  43.82 
 
 
347 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  43.82 
 
 
347 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  44.08 
 
 
321 aa  257  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  43.53 
 
 
347 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  43.53 
 
 
347 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  43.82 
 
 
347 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  42.01 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  42.64 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>