More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0099 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  100 
 
 
320 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  49.53 
 
 
342 aa  309  4e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  52.41 
 
 
347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  52.92 
 
 
309 aa  300  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  50.97 
 
 
348 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  53.05 
 
 
328 aa  299  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  51.32 
 
 
316 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  47.9 
 
 
343 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  48.22 
 
 
343 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  51.59 
 
 
317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  51.83 
 
 
327 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  47.97 
 
 
315 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  45.43 
 
 
340 aa  279  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  49.37 
 
 
316 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  47.99 
 
 
352 aa  277  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  45.87 
 
 
326 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  49.22 
 
 
355 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  48.6 
 
 
351 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  49.01 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  46.44 
 
 
317 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  49.04 
 
 
314 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  46.37 
 
 
328 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  45.03 
 
 
323 aa  265  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  48.37 
 
 
343 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  48.37 
 
 
343 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  45.31 
 
 
346 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  44.51 
 
 
344 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  48.29 
 
 
345 aa  255  9e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  45.28 
 
 
354 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  40.32 
 
 
354 aa  249  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  47.02 
 
 
340 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  45.95 
 
 
343 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  49.65 
 
 
319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  43.42 
 
 
337 aa  238  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  46.35 
 
 
348 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  41.4 
 
 
358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  40.63 
 
 
344 aa  230  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  42.32 
 
 
318 aa  230  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  44.06 
 
 
359 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  41.83 
 
 
343 aa  227  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  42.9 
 
 
346 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  47.16 
 
 
291 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  43.17 
 
 
351 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  45.21 
 
 
350 aa  225  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  42.58 
 
 
347 aa  225  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  42.07 
 
 
347 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  42.95 
 
 
350 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  43 
 
 
325 aa  224  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  44.41 
 
 
354 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  41.14 
 
 
351 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  43.34 
 
 
348 aa  223  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  43.42 
 
 
358 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  42.58 
 
 
360 aa  222  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  39.26 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  41.8 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  43.3 
 
 
351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6596  selenide, water dikinase  43.27 
 
 
381 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  43.21 
 
 
321 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  45.16 
 
 
297 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  41.8 
 
 
347 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  41.8 
 
 
347 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  41.8 
 
 
347 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  37.94 
 
 
320 aa  219  5e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  41.8 
 
 
347 aa  219  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  41.8 
 
 
347 aa  219  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  41.8 
 
 
347 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  41.48 
 
 
347 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  41.48 
 
 
347 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  43.44 
 
 
349 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  43.39 
 
 
352 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  44.76 
 
 
353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  39.94 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  38.93 
 
 
340 aa  216  4e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  40.76 
 
 
352 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  41.12 
 
 
352 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  41.12 
 
 
352 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  41.12 
 
 
352 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  43.85 
 
 
354 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  43.69 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  43.85 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  40.65 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  42.39 
 
 
348 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  42.39 
 
 
348 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  43.69 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  43.69 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  44.71 
 
 
389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0666  selenide, water dikinase  44.04 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  43.19 
 
 
354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  43.19 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  43.19 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  40.62 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  43.28 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  42.52 
 
 
354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  40.32 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  42.52 
 
 
354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  43.19 
 
 
357 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  42.52 
 
 
356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  41.61 
 
 
345 aa  212  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  41.18 
 
 
352 aa  212  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  42.17 
 
 
347 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>