281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0830 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  100 
 
 
325 aa  661    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  50.15 
 
 
343 aa  340  2e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  44.75 
 
 
340 aa  285  5e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  46.82 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  50 
 
 
320 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  43.85 
 
 
317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  44.79 
 
 
343 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  45.13 
 
 
342 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  43.56 
 
 
340 aa  269  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  44.17 
 
 
343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  42.51 
 
 
343 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  47.12 
 
 
317 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  44.48 
 
 
347 aa  262  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  42.77 
 
 
343 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  42.51 
 
 
348 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  40.44 
 
 
378 aa  259  4e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  44.19 
 
 
317 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  44.26 
 
 
323 aa  258  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  47.1 
 
 
316 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  43.89 
 
 
355 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  43.27 
 
 
326 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  43.04 
 
 
354 aa  256  5e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  44.34 
 
 
328 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  43.57 
 
 
351 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  41.54 
 
 
343 aa  255  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  41.23 
 
 
340 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  45.12 
 
 
309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  44.26 
 
 
314 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  44.88 
 
 
328 aa  248  9e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  44.14 
 
 
345 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  44.61 
 
 
347 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  43.17 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  41.59 
 
 
346 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  42.72 
 
 
315 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  41.94 
 
 
316 aa  236  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  38.79 
 
 
344 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  42.43 
 
 
344 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2135  selenide, water dikinase  45.85 
 
 
248 aa  229  7e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  39.33 
 
 
348 aa  226  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  40.57 
 
 
352 aa  225  8e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  44 
 
 
337 aa  224  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  43 
 
 
320 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  40.48 
 
 
351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  43 
 
 
327 aa  221  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  40.8 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  41.12 
 
 
321 aa  219  5e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  43.79 
 
 
321 aa  219  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  40.67 
 
 
356 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  40.67 
 
 
356 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  35.95 
 
 
333 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  40.79 
 
 
360 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  40.27 
 
 
350 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  40.43 
 
 
352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  38.83 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  40.43 
 
 
352 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  39.13 
 
 
358 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  39.68 
 
 
353 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  38.82 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  43.27 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04230  selenophosphate synthase  43.54 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776099  normal  0.124051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  39.16 
 
 
344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  39.13 
 
 
369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  37.92 
 
 
359 aa  212  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  40.43 
 
 
352 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  43.64 
 
 
291 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  41.46 
 
 
335 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  39.81 
 
 
344 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  37.92 
 
 
671 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  39.72 
 
 
352 aa  209  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  38.71 
 
 
344 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  39.13 
 
 
354 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  38.19 
 
 
344 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5214  selenophosphate synthase  38.11 
 
 
333 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5594  selenophosphate synthase  38.11 
 
 
333 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5302  selenophosphate synthase  38.11 
 
 
333 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  38.8 
 
 
355 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  37.94 
 
 
352 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  37.94 
 
 
352 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  36.16 
 
 
357 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  37.29 
 
 
314 aa  206  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  38.64 
 
 
357 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  37.94 
 
 
352 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  37.1 
 
 
347 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  39.72 
 
 
352 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  38 
 
 
346 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  38.46 
 
 
347 aa  206  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  38.83 
 
 
345 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  40.07 
 
 
346 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  36.58 
 
 
359 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  36.33 
 
 
358 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  38.19 
 
 
344 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  38.06 
 
 
344 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  40 
 
 
351 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  37.12 
 
 
356 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  37.12 
 
 
354 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  37.12 
 
 
354 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  37.25 
 
 
348 aa  202  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  37.54 
 
 
348 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  38.79 
 
 
362 aa  202  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  40.21 
 
 
389 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.605066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>