229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1778 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  100 
 
 
378 aa  767    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  49 
 
 
317 aa  324  2e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  44.85 
 
 
340 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  42.86 
 
 
343 aa  291  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  50.88 
 
 
308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  51.26 
 
 
320 aa  270  2e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  40.44 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  37.7 
 
 
348 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2135  selenide, water dikinase  51.42 
 
 
248 aa  252  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  46.15 
 
 
323 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  37.8 
 
 
343 aa  249  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  38.68 
 
 
347 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  44.71 
 
 
317 aa  242  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  39.67 
 
 
343 aa  242  9e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  43.1 
 
 
326 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  36.74 
 
 
347 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  39.34 
 
 
343 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  36.14 
 
 
343 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  36.31 
 
 
343 aa  235  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  44.4 
 
 
309 aa  235  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  37.37 
 
 
345 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  35.96 
 
 
342 aa  230  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  41.55 
 
 
316 aa  229  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  34.9 
 
 
346 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  37.74 
 
 
351 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  42.39 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  44.24 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  44.44 
 
 
317 aa  220  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  42.55 
 
 
316 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  36.9 
 
 
340 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  37.78 
 
 
354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  36.39 
 
 
344 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  35.68 
 
 
340 aa  216  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  34.82 
 
 
352 aa  215  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  35.51 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  40.65 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  34.14 
 
 
347 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  33.42 
 
 
351 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  41.94 
 
 
328 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  35.51 
 
 
355 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  33.42 
 
 
346 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  44.14 
 
 
314 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  32.82 
 
 
347 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  41.37 
 
 
291 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  35.99 
 
 
352 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  41.18 
 
 
337 aa  206  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  35.99 
 
 
352 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  36.09 
 
 
344 aa  206  7e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  34.58 
 
 
351 aa  206  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  38.91 
 
 
318 aa  205  9e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  35.99 
 
 
352 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  33.68 
 
 
352 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  41.18 
 
 
314 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  33.06 
 
 
346 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  32 
 
 
348 aa  204  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  34.39 
 
 
354 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  33.68 
 
 
352 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  33.68 
 
 
352 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  33.68 
 
 
352 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  35.71 
 
 
352 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  33.88 
 
 
352 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  42.41 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  33.86 
 
 
344 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  34.65 
 
 
344 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  33.6 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  39.72 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  35.31 
 
 
350 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  33.96 
 
 
358 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  33.51 
 
 
351 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  35.29 
 
 
352 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  40.99 
 
 
321 aa  192  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  43.48 
 
 
321 aa  192  9e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  33.51 
 
 
347 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  33.25 
 
 
353 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  33.51 
 
 
347 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  33.51 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  33.51 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  33.51 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  33.51 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  33.51 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  33.51 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  39.49 
 
 
297 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  33.51 
 
 
347 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  32.72 
 
 
347 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  33.86 
 
 
345 aa  189  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  33.98 
 
 
347 aa  189  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  34.76 
 
 
351 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1162  selenophosphate synthetase  32.46 
 
 
343 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  33.88 
 
 
350 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  33.97 
 
 
362 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3755  selenophosphate synthetase  34.66 
 
 
344 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373103  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  32.98 
 
 
347 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  34.55 
 
 
344 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  35.53 
 
 
357 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  35.53 
 
 
354 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  32.98 
 
 
347 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  32.98 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  32.98 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  34.37 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  32.98 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>