257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0362 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  100 
 
 		 320 aa  642    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  61.32 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  62.83 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  50.79 
 
 		 317 aa  309  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  47.85 
 
 		 343 aa  285  7e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  50 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  48.99 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  48.99 
 
 		 343 aa  275  8e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  51.26 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  47.12 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  45.82 
 
 		 315 aa  266  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  42.77 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  43.42 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  42.91 
 
 		 348 aa  248  8e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  45.36 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  42.41 
 
 		 346 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  43.12 
 
 		 343 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  45.14 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  46.79 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  43.88 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  44.32 
 
 		 345 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  41.67 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  43.45 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  45.85 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2135  selenide, water dikinase  52.05 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  45.21 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  42.64 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  43.52 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  42.33 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  44.08 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  41.75 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  44.41 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  42.86 
 
 		 316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  45 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  37.94 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  43.51 
 
 		 351 aa  219  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  41.36 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  41.41 
 
 		 355 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  40.96 
 
 		 350 aa  215  8e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  40.68 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  41.2 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  40.07 
 
 		 354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  41.49 
 
 		 314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  40.38 
 
 		 337 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  39.13 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  40.83 
 
 		 352 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  40.97 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  40.83 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  40.83 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  38.85 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  39.46 
 
 		 347 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  40.35 
 
 		 327 aa  208  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  40.27 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  40.71 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  42.7 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  38.06 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  40.07 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  39.93 
 
 		 352 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  39.93 
 
 		 352 aa  206  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  39.29 
 
 		 352 aa  205  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  37.96 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  38.98 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  37.25 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  38.26 
 
 		 346 aa  202  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  37.54 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  42.16 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  42.7 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  36.54 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  40.58 
 
 		 351 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  39.93 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  39.47 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  38.13 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  41.3 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  40.94 
 
 		 347 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  40.41 
 
 		 351 aa  195  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  40.94 
 
 		 347 aa  195  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  40.94 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  40.29 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  40.94 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  37.11 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  36.16 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  38.1 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  40.58 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  40.58 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  38.83 
 
 		 328 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  40.94 
 
 		 347 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  36.28 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  40.66 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  37 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1162  selenophosphate synthetase  37.17 
 
 		 343 aa  190  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  36.75 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  37.63 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  37.04 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  37.67 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  39.05 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  39.05 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  39.05 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  39.05 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  37.71 
 
 		 357 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  35.02 
 
 		 348 aa  189  7e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>