More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2461 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  100 
 
 		 354 aa  714    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  51.02 
 
 		 352 aa  343  2e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  50 
 
 		 343 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  49.4 
 
 		 343 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  49.13 
 
 		 347 aa  322  5e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  47.65 
 
 		 347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  46.63 
 
 		 342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  53.52 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  51.01 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  47.02 
 
 		 348 aa  299  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  48.95 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  48.85 
 
 		 328 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  44.54 
 
 		 358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  44.81 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  47 
 
 		 315 aa  278  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  47.76 
 
 		 317 aa  278  9e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  43.28 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  45.1 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  44.54 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  46.58 
 
 		 343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  47.1 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  43.87 
 
 		 323 aa  266  5e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  44.1 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  42.55 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  46.53 
 
 		 326 aa  258  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  43.23 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  43.42 
 
 		 345 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  43.04 
 
 		 325 aa  256  6e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  44.05 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  42.31 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  42.99 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  46.59 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  40.32 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  43.9 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  43.64 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  42.31 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  42.81 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  40.57 
 
 		 343 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  39.94 
 
 		 343 aa  245  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  43.36 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  43.16 
 
 		 321 aa  236  6e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  41.09 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  45.21 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  42.75 
 
 		 321 aa  232  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  40.96 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  44.53 
 
 		 319 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  42.99 
 
 		 351 aa  232  8.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  44.8 
 
 		 291 aa  232  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  42.3 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  41.69 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  39.2 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  39.46 
 
 		 346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  40.58 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  40.58 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  39.38 
 
 		 352 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  40.58 
 
 		 347 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  40.58 
 
 		 347 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  40.58 
 
 		 347 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  40.58 
 
 		 347 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  40.51 
 
 		 344 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  40.58 
 
 		 347 aa  222  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  41.28 
 
 		 340 aa  222  8e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  40.26 
 
 		 347 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  40.26 
 
 		 347 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  37.99 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  39.43 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  39.36 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  39.25 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  38.51 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  38.54 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  40.33 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  40.33 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  39.43 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  39.43 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  40.33 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  40.19 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  38.63 
 
 		 352 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  39.06 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  39.12 
 
 		 352 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  40 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  38.89 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  39.06 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  40 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  40.87 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  41.06 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  41.28 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  41.06 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  40 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  37.94 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  37.78 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  36.86 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  38.39 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  40.58 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  39.94 
 
 		 349 aa  216  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  42.86 
 
 		 353 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  39.46 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  40.4 
 
 		 357 aa  215  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  40.4 
 
 		 354 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  40.4 
 
 		 357 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  40.4 
 
 		 357 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>