297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1753 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  100 
 
 		 348 aa  699    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  47.37 
 
 		 358 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  47.65 
 
 		 347 aa  298  8e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  45.77 
 
 		 347 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  43.67 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  44.64 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  46.27 
 
 		 351 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  42.68 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  45.95 
 
 		 309 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  47.02 
 
 		 355 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  47.08 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  42.68 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  42.65 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  42.55 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  49.68 
 
 		 317 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  45.31 
 
 		 328 aa  259  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  47.02 
 
 		 316 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  47.26 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  42.51 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  43.58 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  40.13 
 
 		 344 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  45.7 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  41.9 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  40.58 
 
 		 323 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  44.69 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  40.91 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  41.57 
 
 		 350 aa  248  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  43.67 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  43.48 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  42.81 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  42.81 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  41 
 
 		 354 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  45.02 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  44.05 
 
 		 346 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  44.61 
 
 		 357 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  39.77 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  44.61 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  41.27 
 
 		 352 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  48.43 
 
 		 319 aa  246  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  43.5 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  41.32 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  40.06 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  44.01 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  44.01 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  39.94 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  44.01 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  42.49 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  43.2 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  40.58 
 
 		 351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  39.21 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  43.03 
 
 		 671 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  43.71 
 
 		 357 aa  241  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  44.31 
 
 		 357 aa  241  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  42.07 
 
 		 316 aa  242  9e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  44.73 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  41.69 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  44.17 
 
 		 355 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  47.46 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  39.39 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3450  selenophosphate synthetase  43.52 
 
 		 351 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111292  normal  0.645552 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  43.11 
 
 		 389 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  42.39 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  42.77 
 
 		 385 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  43.29 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  42.77 
 
 		 421 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  41.62 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  39.76 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3716  selenophosphate synthetase  43.23 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  42.99 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  39.76 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  39.76 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  43.41 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  42.99 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  42.99 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  40.19 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  42.2 
 
 		 354 aa  235  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  42.03 
 
 		 315 aa  235  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  43.59 
 
 		 333 aa  235  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  40.06 
 
 		 352 aa  235  9e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  39.59 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  38.78 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0583  selenide, water dikinase  45.82 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  42.49 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  38.79 
 
 		 346 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  43.2 
 
 		 318 aa  232  9e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  40.82 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  42.53 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  43.07 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  41.69 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  42.96 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  46.13 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  41.99 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  41.99 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  43.93 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  38.41 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  38.41 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  38.53 
 
 		 351 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  45.27 
 
 		 349 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  38.89 
 
 		 346 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  38.41 
 
 		 347 aa  229  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>