276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1241 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  100 
 
 		 309 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  58.5 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  60.2 
 
 		 347 aa  362  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  56.54 
 
 		 343 aa  352  5e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  56.21 
 
 		 343 aa  348  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  58.53 
 
 		 328 aa  346  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  54.05 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  52.82 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  52.27 
 
 		 348 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  54.52 
 
 		 317 aa  309  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  53.52 
 
 		 354 aa  309  4e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  48.2 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  49.67 
 
 		 323 aa  305  9.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  49.84 
 
 		 316 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  52.92 
 
 		 320 aa  300  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  50.49 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  50.81 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  50.16 
 
 		 316 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  51.21 
 
 		 326 aa  295  8e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  51.13 
 
 		 351 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  51.02 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  55.64 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  50.49 
 
 		 314 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  51.03 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  51.46 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  47.68 
 
 		 352 aa  286  4e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  50.52 
 
 		 327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  56.55 
 
 		 319 aa  281  9e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  46.75 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  47.81 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  50.92 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  46.8 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  49.65 
 
 		 340 aa  275  9e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  49.83 
 
 		 350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  47.12 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  47.85 
 
 		 344 aa  269  4e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  45.95 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  50.55 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  40.91 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  44.52 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  44.15 
 
 		 360 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  51.49 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  44.15 
 
 		 321 aa  256  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  45.12 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  48.39 
 
 		 291 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  43.29 
 
 		 357 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  48.59 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  42.42 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  44.78 
 
 		 354 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  44.78 
 
 		 354 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  44.78 
 
 		 356 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  42.42 
 
 		 356 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  45.12 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  44.09 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  43.32 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  45.12 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  44.44 
 
 		 385 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  44.08 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  44.44 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  44.44 
 
 		 421 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  43.85 
 
 		 358 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  44.44 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  44.44 
 
 		 354 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  44.44 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  45.9 
 
 		 328 aa  245  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  47.22 
 
 		 337 aa  245  9e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  43.32 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  44.11 
 
 		 389 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  45.03 
 
 		 340 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  41.97 
 
 		 671 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  43.85 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  43.43 
 
 		 357 aa  242  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  44.34 
 
 		 357 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  44.11 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  43.14 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  49.81 
 
 		 335 aa  238  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  42.9 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  43.1 
 
 		 355 aa  237  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  40.07 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  40.72 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  44.4 
 
 		 378 aa  235  7e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  43.77 
 
 		 353 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  48.89 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  42.9 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  40.2 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  41.53 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  41.31 
 
 		 351 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  40.13 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  41.95 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  44.11 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  43.43 
 
 		 347 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5690  selenide, water dikinase  50 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  43.43 
 
 		 347 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  43.1 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  43.1 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0583  selenide, water dikinase  47.78 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  43.1 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  43.1 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  43.43 
 
 		 347 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  41.67 
 
 		 352 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>