214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2225 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  100 
 
 		 297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  61.97 
 
 		 350 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  59.3 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  57.34 
 
 		 351 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  57.75 
 
 		 321 aa  333  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  53.98 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  52.52 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  52.78 
 
 		 317 aa  265  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  50.18 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  50.9 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  47.02 
 
 		 343 aa  258  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  47.57 
 
 		 347 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  51.49 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  46.67 
 
 		 343 aa  255  7e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  49.11 
 
 		 348 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  46.55 
 
 		 347 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  45.04 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  49.46 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  48.38 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  44.44 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  43.9 
 
 		 342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  45.14 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  40.96 
 
 		 354 aa  232  5e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  46.59 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  46.15 
 
 		 344 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  48.94 
 
 		 345 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  45.45 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  41.78 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  45.16 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  42.91 
 
 		 351 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  43.3 
 
 		 314 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  44.48 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  44.03 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  44.33 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  41.92 
 
 		 317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  42.91 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  41.4 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  38.06 
 
 		 358 aa  210  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  46.62 
 
 		 291 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  42.66 
 
 		 354 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  48.02 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  44.71 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  40.57 
 
 		 344 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  43.01 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  40.28 
 
 		 340 aa  202  5e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  43.55 
 
 		 340 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  40.56 
 
 		 348 aa  202  8e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  42.7 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  39.86 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  46.12 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  44.84 
 
 		 356 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  44.84 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  39.25 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  37.5 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  39.49 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  40.67 
 
 		 352 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  39.93 
 
 		 325 aa  187  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  40.14 
 
 		 357 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  40.28 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  37.98 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  38.11 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  39.55 
 
 		 352 aa  185  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  39.55 
 
 		 352 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  39.58 
 
 		 344 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  44.05 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  39.55 
 
 		 352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  41.27 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  39.7 
 
 		 352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  39.24 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  39.7 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  42.05 
 
 		 354 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  39.7 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  40.78 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  40.93 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  38.75 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  40.93 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  40.93 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  40.21 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  40.21 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  39.45 
 
 		 344 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  40.21 
 
 		 354 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  41.29 
 
 		 358 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  39.45 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  40.57 
 
 		 421 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1162  selenophosphate synthetase  38.89 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  40.57 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  40.57 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  39.45 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1627  selenide, water dikinase  44.79 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  40.93 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  41.04 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  40.3 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  41.11 
 
 		 671 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0583  selenide, water dikinase  43.97 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5690  selenide, water dikinase  46.3 
 
 		 343 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  40.69 
 
 		 344 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  37.27 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  37.02 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  39.79 
 
 		 357 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  39.79 
 
 		 354 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>