More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2761 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  100 
 
 		 346 aa  692    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  62.17 
 
 		 343 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  61.63 
 
 		 345 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  58.38 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  57.8 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  62.06 
 
 		 317 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  56.15 
 
 		 326 aa  349  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  50.5 
 
 		 343 aa  308  9e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  49.41 
 
 		 348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  53.57 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  49.83 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  48.69 
 
 		 347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  53.61 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  45.16 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  44.31 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  56.57 
 
 		 317 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  47.4 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  46.73 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  50 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  47.18 
 
 		 351 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  47.67 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  47.18 
 
 		 355 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  43.77 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  47.67 
 
 		 316 aa  260  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  47.6 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  41.44 
 
 		 340 aa  258  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  39.71 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  45.31 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  43.32 
 
 		 352 aa  253  5.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  47.35 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  45.62 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  48.89 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  42.39 
 
 		 348 aa  248  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  42.47 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  44.04 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  41.59 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  41.77 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  44.79 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  43.91 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  39.41 
 
 		 308 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  42.65 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  44.69 
 
 		 360 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  44.81 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  44.81 
 
 		 344 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  42.56 
 
 		 348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  42.56 
 
 		 348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  42.31 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  42.31 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  42.01 
 
 		 347 aa  232  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  42.31 
 
 		 347 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  39.22 
 
 		 344 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  47.46 
 
 		 319 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  42.26 
 
 		 348 aa  232  9e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  42.01 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  42.9 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  42.01 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  42.01 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  41.38 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  46.1 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  34.9 
 
 		 378 aa  230  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  44.29 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  42.61 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  41.72 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  41.72 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  43.79 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  43.77 
 
 		 344 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  43.77 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  41.57 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  41.84 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  48.73 
 
 		 291 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  41.84 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  41.84 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  41.84 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  41.84 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  40.65 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  42.9 
 
 		 344 aa  225  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2720  selenide, water dikinase  41.07 
 
 		 347 aa  225  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  42.03 
 
 		 344 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  44.2 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  41.91 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  41.72 
 
 		 357 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  37.35 
 
 		 317 aa  222  7e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  43.23 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  41.59 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  43.23 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3755  selenophosphate synthetase  41.64 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  41.72 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  43.77 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  41.72 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  41.72 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  41.85 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  41.72 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  41.72 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4363  selenophosphate synthetase  43.34 
 
 		 344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.040516  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  42.77 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  41.54 
 
 		 356 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  42.86 
 
 		 389 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  42.77 
 
 		 421 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  42.41 
 
 		 359 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  44.12 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>