More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1736 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  100 
 
 		 351 aa  700    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  66 
 
 		 350 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  58.84 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  58.68 
 
 		 318 aa  352  5e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  59.74 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  57.34 
 
 		 297 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  52.07 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  46.2 
 
 		 343 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  45.61 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  47.45 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  47.1 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  47.09 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  52.71 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  45.2 
 
 		 354 aa  275  7e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  53.74 
 
 		 317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  43.2 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  47.66 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  50.32 
 
 		 355 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  50.16 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  50.55 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  44.19 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  44.78 
 
 		 315 aa  265  7e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  47.77 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  43.23 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  44.31 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  45 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  44.71 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  43.29 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  46.67 
 
 		 345 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  47.91 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  44.87 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  42.4 
 
 		 344 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  48.25 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  49.27 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  40.58 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  43.43 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  47.27 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  46.86 
 
 		 351 aa  238  8e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  45.04 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  43.34 
 
 		 346 aa  237  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  42.9 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  47.78 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  41.62 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  41.62 
 
 		 356 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  41.05 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  42.81 
 
 		 345 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  42.32 
 
 		 354 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  42.32 
 
 		 357 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  44.41 
 
 		 320 aa  228  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  43.29 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  41.45 
 
 		 357 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  41.04 
 
 		 358 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6596  selenide, water dikinase  41.81 
 
 		 381 aa  225  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  40.62 
 
 		 354 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  42.44 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  42.44 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  41.16 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  37.76 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  42.44 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  41.16 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  44.72 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  39.88 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  41.16 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  41.16 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  40.48 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  42.43 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  37.74 
 
 		 378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  41.25 
 
 		 340 aa  222  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  42.15 
 
 		 356 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  42.15 
 
 		 385 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  40.41 
 
 		 351 aa  222  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  42.15 
 
 		 421 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  43.81 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1627  selenide, water dikinase  44.73 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  40.86 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  43.3 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  43.01 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  40.29 
 
 		 357 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5690  selenide, water dikinase  44.48 
 
 		 343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  40.59 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  40.43 
 
 		 671 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  39.47 
 
 		 352 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  39.47 
 
 		 352 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  42.44 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  47.43 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  41.1 
 
 		 340 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  39.47 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  40.73 
 
 		 357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  40.19 
 
 		 351 aa  212  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  40.63 
 
 		 353 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  38.29 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  39.71 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  38.39 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  41.94 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  41.72 
 
 		 344 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  39.17 
 
 		 352 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  38.87 
 
 		 352 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  37.97 
 
 		 348 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  39.17 
 
 		 352 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  39.17 
 
 		 352 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>