More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3460 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  100 
 
 		 343 aa  684    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  94.75 
 
 		 343 aa  656    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  69.82 
 
 		 345 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  68.47 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  67.54 
 
 		 317 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  57.56 
 
 		 346 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  61.24 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  51.68 
 
 		 328 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  50.3 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  48.07 
 
 		 347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  44.38 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  44.87 
 
 		 343 aa  299  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  48.53 
 
 		 348 aa  292  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  43.64 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  47.81 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  52.82 
 
 		 317 aa  279  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  48.17 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  41.35 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  43.95 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  45.39 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  48.96 
 
 		 350 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  44.61 
 
 		 344 aa  269  7e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  48.67 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  47.97 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  42.77 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  48.37 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  42.18 
 
 		 352 aa  259  4e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  41.14 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  40.98 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  44.71 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  42.77 
 
 		 340 aa  252  6e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  43.24 
 
 		 369 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  43.95 
 
 		 355 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  48.38 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  45.21 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  42.81 
 
 		 348 aa  246  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  40.57 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  43.12 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  42.81 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  42.19 
 
 		 327 aa  245  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  42.81 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  43.66 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  48.38 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  43.32 
 
 		 321 aa  243  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  40.84 
 
 		 347 aa  243  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  41.18 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  46.3 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2720  selenide, water dikinase  40.35 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  40.84 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  40.84 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  40.18 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  39.76 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  42.94 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  39.76 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  39.76 
 
 		 347 aa  239  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  39.76 
 
 		 347 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  39.76 
 
 		 347 aa  238  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  40.54 
 
 		 348 aa  238  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  39.76 
 
 		 347 aa  238  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  40.29 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  41.36 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  39.47 
 
 		 347 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  39.47 
 
 		 347 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  39.76 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  37.93 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  40.82 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  41.87 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  38.78 
 
 		 352 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  41.57 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  41.57 
 
 		 356 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  41.57 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  41.87 
 
 		 357 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  39.54 
 
 		 317 aa  236  6e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  41.74 
 
 		 345 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  36.31 
 
 		 378 aa  235  7e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  41.14 
 
 		 357 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  41.14 
 
 		 385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  41.27 
 
 		 356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  41.14 
 
 		 421 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  40.96 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  40.96 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  41.44 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  40.96 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  39.94 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  40.12 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  40.12 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  40.12 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  40.12 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  37.9 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  41.92 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  39.14 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  41.44 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  40.12 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  38.67 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  37.95 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  39.64 
 
 		 344 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  37.76 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  40.06 
 
 		 357 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  38.07 
 
 		 351 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  38.62 
 
 		 346 aa  232  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>