More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3249 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  100 
 
 		 316 aa  633  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  62.03 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  55.16 
 
 		 347 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  56.27 
 
 		 328 aa  329  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  57.28 
 
 		 317 aa  318  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  49.68 
 
 		 342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  52.41 
 
 		 328 aa  305  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  49.84 
 
 		 309 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  48.55 
 
 		 343 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  48.23 
 
 		 344 aa  291  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  51.32 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  47.91 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  49.67 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  49.68 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  48.88 
 
 		 347 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  45.27 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  49.66 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  47.59 
 
 		 340 aa  279  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  49.67 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  48.67 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  53.76 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  47.67 
 
 		 346 aa  260  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  48.23 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  50.9 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  45.42 
 
 		 321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  47.44 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  47.44 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  46.18 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  48.45 
 
 		 350 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  47.1 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  48 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  44.41 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  43.61 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  42.99 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  47.44 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  49.46 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  46 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  44.01 
 
 		 337 aa  249  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  45.63 
 
 		 354 aa  249  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  42.62 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  43.04 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  48.25 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  42.72 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  43.17 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  46.79 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  40.26 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  42.07 
 
 		 348 aa  242  7.999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  41.48 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  49.45 
 
 		 319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  43.69 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  41.94 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0666  selenide, water dikinase  41.23 
 
 		 350 aa  235  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  39.3 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  41.69 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  41.99 
 
 		 671 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  41.55 
 
 		 378 aa  229  4e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  42.17 
 
 		 351 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  43.46 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  44.07 
 
 		 351 aa  228  8e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  41 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  42.02 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  41.12 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  41.42 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  43.14 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  43.09 
 
 		 352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  42.61 
 
 		 347 aa  225  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  43.09 
 
 		 352 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  45.62 
 
 		 347 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  42.43 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  40.91 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  44.81 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  41.03 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  37.9 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  40.26 
 
 		 359 aa  222  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  40.71 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  42.43 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  45.45 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  42.07 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  42.07 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  39.87 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  42.07 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  45.45 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  39.67 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  45.09 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  42.07 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  40.38 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  40.38 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  40.38 
 
 		 354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  39.67 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  45.26 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  45.26 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  45.26 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  45.26 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  45.26 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  45.09 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  39.74 
 
 		 351 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  40.38 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  40.38 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  45.09 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  41.85 
 
 		 389 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>