More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2746 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  100 
 
 
321 aa  649    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  58.65 
 
 
350 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  59.34 
 
 
318 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  58.84 
 
 
351 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  53.73 
 
 
328 aa  335  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  57.75 
 
 
297 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  49.84 
 
 
328 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  49.35 
 
 
347 aa  286  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  54.76 
 
 
317 aa  286  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  48.88 
 
 
348 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  46.62 
 
 
315 aa  278  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  47.65 
 
 
328 aa  266  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  46.23 
 
 
343 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  45.9 
 
 
343 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  44.41 
 
 
323 aa  259  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  45.42 
 
 
316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  46.71 
 
 
347 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  44.98 
 
 
342 aa  255  9e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  44.92 
 
 
343 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  45.13 
 
 
326 aa  248  8e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  44.08 
 
 
309 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  44.3 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  43.32 
 
 
343 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  44.87 
 
 
317 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  44.01 
 
 
351 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  44.82 
 
 
344 aa  241  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  41.88 
 
 
354 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  43.69 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  43.04 
 
 
314 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  43.04 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  42.75 
 
 
354 aa  232  5e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  42.96 
 
 
348 aa  230  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  44.24 
 
 
340 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  41.23 
 
 
327 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  42.11 
 
 
346 aa  226  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  43.71 
 
 
343 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  46.04 
 
 
319 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  43.01 
 
 
352 aa  223  4e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  47.41 
 
 
291 aa  222  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  43.38 
 
 
337 aa  222  7e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  46.1 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  43.21 
 
 
320 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  42.86 
 
 
356 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  43.79 
 
 
325 aa  219  6e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  42.52 
 
 
356 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  44.16 
 
 
340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  40.35 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  36.69 
 
 
358 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  43.01 
 
 
321 aa  212  5.999999999999999e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  38.85 
 
 
320 aa  209  4e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6596  selenide, water dikinase  43.23 
 
 
381 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  38.24 
 
 
344 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  39.5 
 
 
353 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  41.14 
 
 
389 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  43.17 
 
 
333 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5690  selenide, water dikinase  43.77 
 
 
343 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  38.78 
 
 
355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  39.13 
 
 
346 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  40.85 
 
 
354 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  41.18 
 
 
354 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  40.85 
 
 
357 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  40.85 
 
 
357 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  40.39 
 
 
358 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  41.18 
 
 
357 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3450  selenophosphate synthetase  42 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111292  normal  0.645552 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  37.94 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  39.31 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  37.93 
 
 
360 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1627  selenide, water dikinase  43.38 
 
 
339 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  40.62 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  39.5 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  41.41 
 
 
354 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  41.41 
 
 
354 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  41.41 
 
 
356 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  40.72 
 
 
354 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  39.79 
 
 
359 aa  196  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3716  selenophosphate synthetase  41.67 
 
 
351 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  39.27 
 
 
308 aa  195  9e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  38.08 
 
 
354 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  38.91 
 
 
340 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  41.08 
 
 
356 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0666  selenide, water dikinase  38.21 
 
 
350 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  41.08 
 
 
385 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  41.08 
 
 
421 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04230  selenophosphate synthase  41.76 
 
 
357 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776099  normal  0.124051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  40.97 
 
 
357 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  37.79 
 
 
369 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  40.99 
 
 
378 aa  192  4e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  38.62 
 
 
357 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  40.72 
 
 
389 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  40.85 
 
 
351 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  41.28 
 
 
351 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  40.27 
 
 
671 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  39.07 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0583  selenide, water dikinase  43.7 
 
 
337 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09630  selenophosphate synthase  41.99 
 
 
338 aa  189  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  36.25 
 
 
347 aa  188  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  37.58 
 
 
346 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  37.72 
 
 
357 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  36.75 
 
 
351 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>