More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04230 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04230  selenophosphate synthase  100 
 
 		 357 aa  706    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776099  normal  0.124051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3578  selenide, water dikinase  70.21 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.319488  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  71.88 
 
 		 335 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  64.72 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1627  selenide, water dikinase  69.47 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09630  selenophosphate synthase  66.37 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524935  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5214  selenophosphate synthase  65.33 
 
 		 333 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5594  selenophosphate synthase  65.33 
 
 		 333 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5302  selenophosphate synthase  65.33 
 
 		 333 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3731  selenide, water dikinase  64.51 
 
 		 354 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.0271033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0583  selenide, water dikinase  62.42 
 
 		 337 aa  374  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0549  selenide, water dikinase  65.11 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0990426  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5690  selenide, water dikinase  63.21 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1607  selenide, water dikinase  66.07 
 
 		 333 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0105208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  54.22 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  53.9 
 
 		 355 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  56.34 
 
 		 316 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  45.34 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  46.77 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2720  selenide, water dikinase  47.23 
 
 		 347 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  45.95 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  45.98 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  45.98 
 
 		 352 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  45.98 
 
 		 352 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  45.98 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  46.13 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  46.25 
 
 		 348 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  46.25 
 
 		 348 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  47.91 
 
 		 345 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  45.66 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  47.59 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  45.6 
 
 		 352 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  45.95 
 
 		 347 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  45.95 
 
 		 347 aa  256  6e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  44.16 
 
 		 347 aa  256  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  45.31 
 
 		 352 aa  255  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  47.27 
 
 		 344 aa  255  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  45.95 
 
 		 347 aa  255  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  45.95 
 
 		 347 aa  255  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  45.95 
 
 		 347 aa  255  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  45.95 
 
 		 347 aa  255  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  46.25 
 
 		 348 aa  255  9e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  45.78 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  45.83 
 
 		 346 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  46.13 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  56.25 
 
 		 314 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  45.78 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  46.62 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  47.5 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  46.3 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  46.93 
 
 		 362 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  45.19 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  46.45 
 
 		 344 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4363  selenophosphate synthetase  46.13 
 
 		 344 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.040516  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  43.91 
 
 		 351 aa  249  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  46.13 
 
 		 344 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  46.45 
 
 		 344 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  45.6 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  45.81 
 
 		 344 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  43.45 
 
 		 346 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  44.3 
 
 		 353 aa  247  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  44.16 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  44.81 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  44.81 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  44.81 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  44.81 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  44.19 
 
 		 351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  44.81 
 
 		 347 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  46.13 
 
 		 344 aa  246  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3755  selenophosphate synthetase  46.95 
 
 		 344 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  46.13 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  44.23 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3011  selenide, water dikinase  44.83 
 
 		 359 aa  242  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1162  selenophosphate synthetase  43.17 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  43 
 
 		 344 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  40.72 
 
 		 342 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  44.3 
 
 		 355 aa  237  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  45.08 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  44.55 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  46.45 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  45.08 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1621  selenophosphate synthetase  46.93 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  42.72 
 
 		 350 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  45.32 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  39.94 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  39.94 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  40.69 
 
 		 354 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  43.79 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  43.14 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  43.65 
 
 		 369 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  43.46 
 
 		 360 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  44.85 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  46.75 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  45.52 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  42.53 
 
 		 345 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  44.08 
 
 		 345 aa  219  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  45.02 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  43.54 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  42.44 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  44.05 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>