256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3578 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3578  selenide, water dikinase  100 
 
 		 331 aa  654    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.319488  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  78.79 
 
 		 335 aa  502  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09630  selenophosphate synthase  76.23 
 
 		 338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524935  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04230  selenophosphate synthase  70.21 
 
 		 357 aa  431  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776099  normal  0.124051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  67.08 
 
 		 333 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0583  selenide, water dikinase  65.45 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3731  selenide, water dikinase  68.58 
 
 		 354 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.0271033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1627  selenide, water dikinase  66.67 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0549  selenide, water dikinase  67.8 
 
 		 342 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0990426  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5690  selenide, water dikinase  66.88 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1607  selenide, water dikinase  71.02 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0105208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5594  selenophosphate synthase  67.92 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5214  selenophosphate synthase  67.92 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5302  selenophosphate synthase  67.92 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  49.83 
 
 		 351 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  49.5 
 
 		 355 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  49.01 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  48.36 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  51.85 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  47.71 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  51.12 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  49.18 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  46.05 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  48.68 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  45.39 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  47.7 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  45.39 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  45.72 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  45.72 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  45.72 
 
 		 352 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  45.72 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  47.7 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  46.05 
 
 		 352 aa  249  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  47.7 
 
 		 344 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  45.39 
 
 		 352 aa  248  9e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  47.37 
 
 		 344 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  43.56 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  41.09 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4363  selenophosphate synthetase  47.37 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.040516  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  46.38 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  42.68 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  43.75 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  46.05 
 
 		 362 aa  245  8e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  45.36 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  45.07 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  45.07 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  43.46 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  45.57 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  44.55 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  44.55 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  42.67 
 
 		 360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  44.41 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  45.07 
 
 		 348 aa  242  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  44.55 
 
 		 354 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  39.34 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3755  selenophosphate synthetase  47.04 
 
 		 344 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  44.23 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  44.23 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  46.58 
 
 		 353 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  44.08 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  44.08 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  46.96 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  44.08 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2720  selenide, water dikinase  45.07 
 
 		 347 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388711 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  44.08 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  44.08 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  44.23 
 
 		 357 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  44.08 
 
 		 347 aa  239  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  44.08 
 
 		 347 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  44.08 
 
 		 347 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  41.77 
 
 		 351 aa  239  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  42.99 
 
 		 353 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  44.08 
 
 		 347 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  42.81 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1162  selenophosphate synthetase  44.05 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  43.93 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  42.86 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  44.08 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  43.39 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  45 
 
 		 354 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  45.6 
 
 		 357 aa  235  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  45 
 
 		 354 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  45 
 
 		 356 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  44.69 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  43.61 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  42.72 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  43.63 
 
 		 671 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  44.08 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  38.76 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  38.64 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  43.42 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  44.01 
 
 		 349 aa  232  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1621  selenophosphate synthetase  48.52 
 
 		 361 aa  232  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  44.62 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  44.38 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  44.38 
 
 		 421 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  42.67 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  42.67 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  41.12 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  43.75 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>