More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0884 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  100 
 
 
344 aa  687    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  60.69 
 
 
319 aa  378  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  49.13 
 
 
347 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  46.65 
 
 
348 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  47.56 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  46.29 
 
 
342 aa  301  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  46.96 
 
 
351 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  46.96 
 
 
355 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  48.23 
 
 
316 aa  291  9e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  51.03 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  47.63 
 
 
316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  46.71 
 
 
347 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  45.7 
 
 
343 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  46.13 
 
 
323 aa  279  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  45.09 
 
 
343 aa  278  7e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  45.15 
 
 
340 aa  273  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  44.38 
 
 
328 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  44.38 
 
 
354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  42.64 
 
 
352 aa  265  8e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  48.61 
 
 
317 aa  262  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  43.96 
 
 
326 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  44.73 
 
 
314 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  45.16 
 
 
315 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2720  selenide, water dikinase  45.4 
 
 
347 aa  258  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  41.74 
 
 
343 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  42.9 
 
 
343 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  44.51 
 
 
320 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  43.11 
 
 
352 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  41.14 
 
 
343 aa  256  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  41.28 
 
 
346 aa  255  7e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  44.54 
 
 
347 aa  255  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  42.77 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  44.27 
 
 
347 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  43.34 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  43.03 
 
 
340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  44.14 
 
 
352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  41.11 
 
 
359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  43.12 
 
 
346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  44.14 
 
 
352 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  44.14 
 
 
352 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  44.14 
 
 
352 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  47.87 
 
 
291 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  43.34 
 
 
352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  44.75 
 
 
347 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  43.15 
 
 
345 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  40.13 
 
 
348 aa  252  7e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  42.68 
 
 
333 aa  252  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  42.41 
 
 
351 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  43.34 
 
 
351 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  43.77 
 
 
347 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  43.77 
 
 
347 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  43.77 
 
 
347 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  44.95 
 
 
348 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  42.86 
 
 
343 aa  251  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  44.95 
 
 
348 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  43.03 
 
 
352 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  43.6 
 
 
347 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  43.6 
 
 
347 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  43.77 
 
 
347 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  43.31 
 
 
347 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  45.28 
 
 
348 aa  250  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  43.6 
 
 
347 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  43.6 
 
 
347 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  43.6 
 
 
347 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  43.6 
 
 
347 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  43.6 
 
 
347 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  43.31 
 
 
347 aa  248  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  43.31 
 
 
347 aa  248  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  41.06 
 
 
389 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  41.47 
 
 
357 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  41.59 
 
 
349 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  42.06 
 
 
360 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  41.45 
 
 
346 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  42.61 
 
 
351 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  42.81 
 
 
362 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  42.09 
 
 
358 aa  247  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  42.4 
 
 
351 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  42.81 
 
 
345 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  40.23 
 
 
355 aa  246  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  42.56 
 
 
344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0583  selenide, water dikinase  41.21 
 
 
337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  40.58 
 
 
358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  43.42 
 
 
335 aa  245  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  45.72 
 
 
352 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  40.87 
 
 
354 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  39.94 
 
 
356 aa  242  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  40.41 
 
 
348 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  39.65 
 
 
356 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  41.94 
 
 
317 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  42.26 
 
 
344 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  41.34 
 
 
321 aa  240  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  40.96 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  42.43 
 
 
344 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  40.06 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  39.83 
 
 
344 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  40.23 
 
 
357 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  40.06 
 
 
357 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3578  selenide, water dikinase  43.56 
 
 
331 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.319488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  42.26 
 
 
344 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09630  selenophosphate synthase  44.12 
 
 
338 aa  238  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>