More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3401 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  100 
 
 		 317 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  60.9 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  58.75 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  58.05 
 
 		 348 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  57.28 
 
 		 316 aa  339  5e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  57.53 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  55.74 
 
 		 323 aa  331  9e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  54.52 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  54.76 
 
 		 321 aa  322  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  52.51 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  48.71 
 
 		 342 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  52.17 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  54.63 
 
 		 316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  53.97 
 
 		 328 aa  311  5.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  54.33 
 
 		 340 aa  308  5e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  54.3 
 
 		 326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  52.49 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  53.74 
 
 		 351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  51.59 
 
 		 320 aa  302  6.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  56.57 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  50.17 
 
 		 315 aa  299  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  57.39 
 
 		 343 aa  298  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  49.84 
 
 		 350 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  48.24 
 
 		 354 aa  295  8e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  53.68 
 
 		 343 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  54.39 
 
 		 343 aa  292  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  51.92 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  51.12 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  51.44 
 
 		 355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  48.54 
 
 		 352 aa  287  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  51.12 
 
 		 314 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  50.16 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  52.78 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  54.77 
 
 		 317 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  47.44 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  48.61 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  55.22 
 
 		 345 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  47.25 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  48.96 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  41.67 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  51.2 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  48.01 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  45.07 
 
 		 350 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  45.87 
 
 		 359 aa  259  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  47.47 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  49.5 
 
 		 340 aa  258  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  53.43 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  44.05 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  44.27 
 
 		 317 aa  255  6e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  47.67 
 
 		 321 aa  255  7e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  46.8 
 
 		 357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  46.8 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  45.79 
 
 		 354 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  45.79 
 
 		 357 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  45.79 
 
 		 357 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  42.49 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  45.3 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  46.13 
 
 		 348 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  46.8 
 
 		 359 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  42.49 
 
 		 308 aa  248  9e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  41.48 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  44.44 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  43.14 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  46.13 
 
 		 354 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  46.13 
 
 		 356 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  45.45 
 
 		 357 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  46.13 
 
 		 354 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  45.21 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  44.33 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  47.13 
 
 		 351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  45.64 
 
 		 356 aa  245  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  44.37 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  45.79 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  45.79 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  45.79 
 
 		 421 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  44.44 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  45.3 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  42.05 
 
 		 346 aa  243  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  45.39 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  45.3 
 
 		 671 aa  242  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  45.97 
 
 		 355 aa  242  6e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  45.12 
 
 		 354 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  43.69 
 
 		 352 aa  241  9e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  43.69 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  41.69 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  45.3 
 
 		 389 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  42.95 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  42.91 
 
 		 352 aa  239  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  45.45 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  43.34 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  42.14 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  46.26 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  47.47 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  44.44 
 
 		 389 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2723  selenophosphate synthetase  44.59 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  42.56 
 
 		 352 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  42.56 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  42.56 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  45.02 
 
 		 352 aa  235  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  45.12 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>