281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1535 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  100 
 
 
328 aa  658    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  63.95 
 
 
347 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  60.5 
 
 
328 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  54.05 
 
 
309 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  53.23 
 
 
347 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  50.32 
 
 
343 aa  315  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  50.65 
 
 
343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  54.13 
 
 
348 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  48.23 
 
 
342 aa  310  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  52.41 
 
 
316 aa  305  6e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  51.01 
 
 
354 aa  300  3e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  49.5 
 
 
323 aa  299  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  48.58 
 
 
315 aa  297  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  51.27 
 
 
326 aa  295  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  53.97 
 
 
317 aa  295  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  51.95 
 
 
340 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  50.49 
 
 
351 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  50.17 
 
 
314 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  50.16 
 
 
355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  50.17 
 
 
343 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  49.37 
 
 
350 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  46.13 
 
 
340 aa  278  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  49.84 
 
 
316 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  52.71 
 
 
351 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  49.68 
 
 
317 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  49.66 
 
 
318 aa  276  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  48.17 
 
 
343 aa  276  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  52 
 
 
343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  55.76 
 
 
291 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  44.38 
 
 
344 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  45.51 
 
 
343 aa  267  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  50 
 
 
327 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  46.37 
 
 
320 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  44.65 
 
 
344 aa  266  4e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  47.65 
 
 
321 aa  266  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  50.73 
 
 
346 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  53.33 
 
 
345 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  50.18 
 
 
297 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  45.31 
 
 
348 aa  259  4e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  43 
 
 
358 aa  258  8e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  51.4 
 
 
354 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  51.75 
 
 
319 aa  255  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  47.48 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  44.27 
 
 
321 aa  250  3e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  44.88 
 
 
325 aa  248  9e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  42.41 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  44.82 
 
 
357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  42.99 
 
 
351 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  42.68 
 
 
352 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  45.08 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  42.95 
 
 
347 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  44.3 
 
 
314 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  44.84 
 
 
352 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  40.73 
 
 
317 aa  237  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  49.11 
 
 
351 aa  236  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  42.68 
 
 
356 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  42.68 
 
 
356 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  40.59 
 
 
347 aa  235  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  43.73 
 
 
359 aa  235  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  41.25 
 
 
346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  44.48 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  42.67 
 
 
360 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  44.13 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  44.13 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  42.67 
 
 
308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  44.13 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  44.13 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  42.33 
 
 
340 aa  232  5e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  40.47 
 
 
354 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  43.77 
 
 
352 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  40.47 
 
 
353 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  44.01 
 
 
337 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  42.26 
 
 
346 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  43.77 
 
 
352 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  44.59 
 
 
671 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  42.9 
 
 
357 aa  228  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  41.75 
 
 
320 aa  228  1e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  42.53 
 
 
389 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  42.16 
 
 
357 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  44.62 
 
 
349 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  42.35 
 
 
348 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0666  selenide, water dikinase  42.07 
 
 
350 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  42.48 
 
 
354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  41.83 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  42.48 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  41.83 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  41.83 
 
 
354 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  42.77 
 
 
348 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2723  selenophosphate synthetase  44.52 
 
 
347 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280916  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  42.96 
 
 
352 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  41 
 
 
348 aa  222  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  45.49 
 
 
333 aa  222  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  42.38 
 
 
369 aa  221  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  42 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  42 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  42 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  42 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  42 
 
 
347 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  40.78 
 
 
357 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  42 
 
 
347 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>