More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11290 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  100 
 
 
321 aa  657    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  70.75 
 
 
351 aa  434  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  66.13 
 
 
314 aa  429  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  45.91 
 
 
347 aa  279  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  48.97 
 
 
340 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  44.27 
 
 
343 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  44.86 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  46.42 
 
 
343 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  44.08 
 
 
347 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  47.73 
 
 
316 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  44.15 
 
 
309 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  45.55 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  46.15 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  44.87 
 
 
317 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  43.32 
 
 
323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  45.93 
 
 
352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  43.59 
 
 
348 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  45.71 
 
 
351 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  45.9 
 
 
327 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  44.27 
 
 
328 aa  249  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  47.06 
 
 
314 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  41.08 
 
 
358 aa  247  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  42.17 
 
 
326 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  41.69 
 
 
344 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  43.73 
 
 
357 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  45.71 
 
 
389 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  46.29 
 
 
355 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  42.38 
 
 
354 aa  241  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  44.69 
 
 
315 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  44.95 
 
 
356 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  44.63 
 
 
356 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  44.76 
 
 
357 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  45.52 
 
 
352 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  43.71 
 
 
352 aa  238  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  45.52 
 
 
352 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  45.52 
 
 
352 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  46.29 
 
 
352 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  43.37 
 
 
360 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  46.13 
 
 
343 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  44.69 
 
 
356 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  43.38 
 
 
352 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  43.85 
 
 
347 aa  235  7e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  44.69 
 
 
354 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  44.69 
 
 
356 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  44.69 
 
 
354 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  43.38 
 
 
352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  43.46 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  44.69 
 
 
385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  44.69 
 
 
421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  43.49 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  43.49 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  43.49 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  43.17 
 
 
354 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  43.49 
 
 
357 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  43.17 
 
 
357 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  43.38 
 
 
352 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  42.11 
 
 
346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  45.29 
 
 
347 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  44.29 
 
 
346 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  45.22 
 
 
352 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  42.39 
 
 
355 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  44.56 
 
 
351 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  42.76 
 
 
351 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  44.57 
 
 
291 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  43.91 
 
 
389 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  43.67 
 
 
351 aa  227  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  43.28 
 
 
340 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  44.13 
 
 
358 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  44.94 
 
 
353 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  43.28 
 
 
671 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  42.99 
 
 
351 aa  225  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  44.37 
 
 
348 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  44.37 
 
 
348 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  41.21 
 
 
320 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  42.6 
 
 
350 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  43.84 
 
 
348 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  40.12 
 
 
344 aa  223  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  41.12 
 
 
325 aa  224  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  44.37 
 
 
348 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  44.56 
 
 
320 aa  224  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  42 
 
 
354 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  43.38 
 
 
349 aa  223  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  41.18 
 
 
317 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  41.12 
 
 
346 aa  222  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  43.37 
 
 
352 aa  222  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  42.02 
 
 
359 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  43.21 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  43.37 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  42.62 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  43.59 
 
 
345 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  38.29 
 
 
308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  43.17 
 
 
354 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  41.97 
 
 
344 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  45.26 
 
 
333 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5690  selenide, water dikinase  47.08 
 
 
343 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  41.29 
 
 
337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  41.97 
 
 
318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  40.13 
 
 
369 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4363  selenophosphate synthetase  46.13 
 
 
344 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.040516  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  37.97 
 
 
340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>