More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0607 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  100 
 
 		 345 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  77.42 
 
 		 343 aa  511  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  71.01 
 
 		 343 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  69.82 
 
 		 343 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  73.19 
 
 		 317 aa  454  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  61.63 
 
 		 346 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  64.31 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  52.99 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  49.71 
 
 		 347 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  53.89 
 
 		 348 aa  316  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  55 
 
 		 328 aa  311  7.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  53.61 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  47.85 
 
 		 343 aa  298  8e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  46.2 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  47.85 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  51.02 
 
 		 351 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  45.88 
 
 		 343 aa  295  7e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  51.02 
 
 		 355 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  47.59 
 
 		 323 aa  282  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  52.58 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  50.99 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  48.33 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  50.96 
 
 		 314 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  46.44 
 
 		 315 aa  276  6e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  46.39 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  54.36 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  48.29 
 
 		 320 aa  271  9e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  51.15 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  43.85 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  50.62 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  44.14 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  45.17 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  42.15 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  42.81 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  46.55 
 
 		 357 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  42.9 
 
 		 340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  47.27 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  51.8 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  43.84 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  42.69 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  46.89 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  42.69 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  42.69 
 
 		 347 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  42.69 
 
 		 347 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  46.01 
 
 		 360 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  42.41 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  47.32 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  42.41 
 
 		 347 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  42.41 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  41.62 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  42.69 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  41.96 
 
 		 347 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  42.12 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  43.26 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  44.15 
 
 		 671 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  41.69 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  37.37 
 
 		 378 aa  246  3e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  42.77 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  42.22 
 
 		 348 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  42.22 
 
 		 348 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  42.2 
 
 		 344 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2720  selenide, water dikinase  42.6 
 
 		 347 aa  245  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388711 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  47.09 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  43.04 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  47.19 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  47.19 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  47.13 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  42.32 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  42.32 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  42.32 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  42.32 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  44.44 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  42.32 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  42.45 
 
 		 352 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  44.63 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  41.91 
 
 		 344 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  41.91 
 
 		 344 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  44.63 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  41.92 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  44.63 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  42.77 
 
 		 344 aa  242  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  46.89 
 
 		 389 aa  242  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  46.18 
 
 		 328 aa  242  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  42.86 
 
 		 348 aa  242  9e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  46.56 
 
 		 357 aa  241  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  46.25 
 
 		 357 aa  241  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  42.19 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  42.77 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  44.23 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  42.19 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  42.25 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  44.69 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  44.23 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  41.88 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  44.35 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  44.35 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  41.39 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  42.01 
 
 		 352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  44.79 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  46.25 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>