264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1627 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1627  selenide, water dikinase  100 
 
 		 339 aa  662    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  73.33 
 
 		 333 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5594  selenophosphate synthase  75.84 
 
 		 333 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5214  selenophosphate synthase  75.84 
 
 		 333 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5302  selenophosphate synthase  75.84 
 
 		 333 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5690  selenide, water dikinase  70.64 
 
 		 343 aa  428  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3731  selenide, water dikinase  72.36 
 
 		 354 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.0271033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1607  selenide, water dikinase  74.31 
 
 		 333 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0105208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0549  selenide, water dikinase  68.62 
 
 		 342 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0990426  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0583  selenide, water dikinase  66.57 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04230  selenophosphate synthase  69.47 
 
 		 357 aa  407  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776099  normal  0.124051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3578  selenide, water dikinase  66.67 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.319488  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  67.71 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09630  selenophosphate synthase  67.19 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524935  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  48.1 
 
 		 344 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  49.57 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  51.96 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  47.81 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  51.63 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  48.06 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  51.31 
 
 		 344 aa  268  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  48.06 
 
 		 352 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  48.06 
 
 		 352 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  48.06 
 
 		 352 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  47.71 
 
 		 352 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  47.4 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2720  selenide, water dikinase  50.32 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388711 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  46.1 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  47.71 
 
 		 352 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  49.67 
 
 		 344 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  47.73 
 
 		 352 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  48.04 
 
 		 352 aa  265  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3011  selenide, water dikinase  48.04 
 
 		 359 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  44.66 
 
 		 351 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4363  selenophosphate synthetase  49.67 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.040516  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  50.81 
 
 		 351 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  44.12 
 
 		 342 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  48.37 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  47.06 
 
 		 352 aa  263  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  50.33 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  48.04 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  46.94 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  50.49 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  48.04 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  46.42 
 
 		 359 aa  262  6e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  48.04 
 
 		 348 aa  262  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  45.63 
 
 		 346 aa  262  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  45.34 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  47.88 
 
 		 347 aa  259  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  47.88 
 
 		 347 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  49.67 
 
 		 345 aa  259  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  47.88 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  47.88 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  47.88 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  47.88 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  47.56 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  47.88 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  47.56 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  48.86 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  43.37 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  44.97 
 
 		 357 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  46.6 
 
 		 351 aa  256  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  49.39 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  49.39 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  52.99 
 
 		 316 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  49.39 
 
 		 354 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  47.88 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  46.91 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  47.88 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  47.88 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  47.88 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  49.39 
 
 		 357 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  47.88 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  49.39 
 
 		 357 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  49.39 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  45.13 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  44.81 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3755  selenophosphate synthetase  48.86 
 
 		 344 aa  252  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1162  selenophosphate synthetase  40.7 
 
 		 343 aa  251  9.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  45.54 
 
 		 369 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  49.68 
 
 		 346 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  49.08 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  48.77 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  49.08 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  49.08 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  49.08 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  49.08 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  49.08 
 
 		 421 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  50.16 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  48.23 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1621  selenophosphate synthetase  50 
 
 		 361 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  45.42 
 
 		 344 aa  245  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  42.73 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  44.34 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  47.73 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  47.12 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  42.42 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  45.91 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  42.53 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  47.25 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>